Condor BusTools-1553-API 高价购买的,condor 1553B 的程序源码对开发1553 很有帮助，里面有篇1553教学文档也很不错。
2021-09-14 16:37:14
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苏拉特对RNA的速度
罗勒·库德（Basil Khuder）
介绍
本指南将演示如何结合RNA Velocity分析使用已处理/标准化的Seurat对象。 请记住，尽管Seurat是基于R的，但是所有可用的RNA Velocity软件/软件包都是Python，因此我们将在两者之间来回移动。 我们将使用以下程序：
scVelo （用于RNA速度）
Velocyto或Kallisto Bustools （产生我们最初的RNA Velocity Object）
Anndata （用于操纵我们的RNA Velocity对象）
苏拉特
Samtools-可选（Velocyto将在未排序的.bam上运行Samtools排序）
生成Loom文件
首先，我们将为您在Seurat分析中使用的每个单细胞样本生成织机文件（一种为基因组数据集（例如单细胞）设计的文件格式）。 织机文件不同于您在Seura
2021-08-28 14:38:31
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pybustools
这是通常使用生成的单细胞RNAseq的的python接口。
安装
请注意所需的gmpy2库，它本身依赖于某些c库。 这些可以通过apt-get install libgmp3-dev libgmp-dev libmpfr-dev libmpc-dev安装在ubuntu上。
git clone https://github.com/redst4r/pybustools
pip install -e pybustools
用法
from pybustools . pybustools import Bus
B = Bus ( folder = '/path/to/bus/output' , bus_name = 'sorted.bus' )
# iterate the records one by one; it yields namedtuples
for reco
2021-02-20 12:04:10
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