Exploring Chemistry with Electronic Structure Methos, Second Edition, 作者James B. Foresman, Eleen Frisch 出版社Gaussian, Inc, USA, 1996 前言 Gaussian可以做很多事情,具体包括 分子能量和结构研究 过渡态的能量和结构研究 化学键以及反应的能量 分子轨道 偶极矩和多极矩 原子电荷和电势 振动频率 红外和拉曼光谱 核磁 极化率和超极化率 热力学性质 反应途径 计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态.Gaussian是研究诸如 取代效应,反应机理,势能面和激发态能量的有力工具. 全书结构 序言 运行Gaussian 第一部分 基本概念和技术 第一章 计算模型 第二章 单点能计算 第三章 几何优化 第四章 频率分析 第二部分 计算化学方法 第五章 基族的影响 第六章 理论方法的选择 第七章 高精度计算 第三部分 应用 第八章 研究反应和反应性 第九章 激发态 第十章 溶液中的反应 附录A 理论背景 附录B Gaussian输入方法简介

Structure and Interpretation of Computer Programs 经典的编程教程SICP 之 Python 描述，中文版。值得收藏。 译本参照的原版在此 http://www-inst.eecs.berkeley.edu/~cs61a/sp12/book/ 翻译版权归译者。

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介绍 使用numpy和scipy库用Python3编写的基本量子化学程序。 当前，该程序完全支持RHF，UHF，CIS，TDHF，DFT，CCSD和CCSD（T）。 我的下一个计划是在程序中实现DFT。 我使用Attlia Szabo和Neil S. Ostlunds的《现代量子化学：高级电子结构理论入门》和《计算量子化学手册》的David B. Cooks作为我对电子结构计算背后的理论和方法的主要参考。 的开发人员资源对于项目的成功也是非常宝贵的，并且拥有许多出色的教程和编程示例。 指示 要运行此程序，请将所需的molfiles和basisset文件添加到molfiles和basisset目录中。 接下来，编辑src/main/main.py menu()函数，以便进行所需的计算，例如， def menu (): start ( 'H2O.mol' , 'STO-3G.g

蛋白质网 ProteinNet是用于机器学习蛋白质结构的标准化数据集。 它提供蛋白质序列，结构（和），多个序列比对（ ），位置特定的评分矩阵（ ），以及标准化的拆分。 ProteinNet建立在两年期评估的基础上，该评估对最近解决但尚未公开获得的蛋白质结构进行盲目预测，以提供推动计算方法学前沿的测试集。 它被组织为一系列数据集，涵盖了CASP 7至12（涵盖十年），以提供一系列数据集大小，从而可以在相对数据贫乏和数据丰富的体制中评估新方法。 请注意，这是一个初步版本。 用于构建数据集的原始数据以及MSA尚未普遍可用。 但是，可应要求提供ProteinNet 12的原始MSA数据（4TB）