rnaSeqPipelineGLBRC.py
目的:
Implementation of the Gasch lab RNA-Seq pipeline.
输入 :
A text file with RNA-Seq fastq files to be processed.
请使用专用目录来运行管道。 创建您的目录并将您的 fastq 文件复制到该目录中。 通过移动到工作目录并运行 /bin/ls *.fastq > input.txt 来生成输入文件
所需参数:
-f input.txt
To run default enter: /home/GLBRCORG/mplace/scripts/rnaSeqPipelineGLBRC.py -f input.txt
可选参数:
-r this will use "-s reverse" parameter for HTSeq
2021-12-07 11:00:23
11KB
Python
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