MSFragger
MSFragger是用于基于质谱的蛋白质组学中肽段鉴定的超快速数据库搜索工具。 它在各种数据集和应用程序中均表现出出色的性能。 MSFragger适用于标准shot弹枪蛋白质组学分析以及大型数据集（包括timsTOF PASEF数据），酶无限制搜索（例如肽组），“开放式”数据库搜索（即前体质量耐受性设置为数百道尔顿），用于鉴定修饰的肽， MSFragger Glyco模式鉴定糖肽（N链和O链）。
MSFragger用跨平台的Java编程语言实现，可以使用三种不同的方式：
使用 GUI（图形用户界面）。
通过
作为独立的Java可执行文件（JAR）
MSFragger以表格或pepXML格式编写输出，使其与下游数据分析管道（如跨蛋白质组学管道和完全兼容。 请参阅，包括的列表。 示例参数文件可在找到。
支持的乐器和文件格式
mzML / mzXML ：可以使用来
2021-10-16 15:51:07
14.01MB
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MVI评估
缺少价值估算和评估，尤其是对于基于MS的代谢组学数据集
MVI_global.R包含一些全局基本功能。
Impute_wrapper.R包含不同的插补包装函数，您可以将自己的插补方法以XXX_wrapper的名称添加到此文件以进行评估。
插补评估R包含我们的插补评估渠道（缺失生成，插补，评估）。
2021-10-16 10:06:54
471KB
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中国科学院微生物研究所所级课程《微生物大数据分析与实践》
主讲老师：胡松年 研究员 ， 贺子龙 副研究员
2021-09-28 19:06:13
109.35MB
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O2PLS分析的代码以及O2PLS得分图，全部载荷图 前15个载荷图代码
2021-09-10 17:15:17
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