在这个项目中,我们使用灰度化、高斯滤波、边缘提取、二值化、腐蚀膨胀、连通分量计数等基础的方法,实现了一个效果良好的细胞计数器。同时,我们提供了丰富的可调节参数设置,使得程序的泛化性更好。
2021-10-21 12:31:55 818KB matlab
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这是maskrcnn keras代码,针对细胞语义分割项目进行了专门的改造,代码中有相应的示例,当这里的代码去掉mask的生成过程,可以当做faster rcnn使用,这是进行细胞语义分割的完整项目,包含训练、测试、记录整个流程
2021-10-20 18:29:25 414KB MaskRC 细胞分割 分割示例
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EPO工程细胞培养方法和反应器.pptx
2021-10-16 20:00:21 2.59MB 技术
这是论文的源代码和数据 显微镜细胞图像中的核分割: Luis Pedro Coelho、Aabid Shariff 和 Robert F. Murphy 的手工分割数据集和算法比较。 DOI: 。 数据 原始数据位于data/目录中。 两个子文件夹gnf和ic100包含手动生成的文件。 在子文件夹preprocessed-data ,您将获得一个更易于使用的处理版本。 这些是标记的整数图像:值 0 对应于背景,1 是第一个单元格,2 是第二个单元格,&c。 引文 完整引用(如果您在论文中使用此代码/数据集,请使用它): @inproceedings{Coelho2009, title = {Nuclear segmentation in microscope cell images: A hand-segmented dataset and comparison of al
2021-10-15 20:36:11 223.58MB TeX
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人教版七年级初一上册生物《观察植物细胞PPT课件》.ppt
2021-10-15 18:03:05 1.62MB 课件 培训 教育 教学
转换组织病理学/细胞病理学机器学习任务的助手 主流程 扫描一些WSI。 使用WSI注释工具进行一些注释。 (和 , 现在可参见了解详情。) 然后wsiprocess帮助将WSI +注释数据转换为补丁和易于使用的注释数据。 将为您提供GUI。 有关请参见 ,以及在已修补图像和从原始WSI加载之间进行。 安装 点用户 安装或 。 有关安装提示,请参见[wiki]。 安装wsiprocess pip install wsiprocess Anaconda用户 # Only for python 3.6 or higher conda install -c tand826 wsiprocess 文献资料 例子 作为python模块 请参阅以检查流。 基本用法 import wsiprocess as wp slide = wp . slide ( "xxx.tiff" ) annot
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脂蛋白 概括 LFPy是一个Python模块,用于根据多室神经元模型计算细胞外电位。 它依靠NEURON模拟器( )并使用Python接口( )提供。 最新变化 刚刚更新了LFPy? 请检查最新的发行说明: : 用法 用LFPy建立的多室神经元模型的细胞外电位的基本模拟: >>> # import modules >>> import LFPy >>> from LFPy import Cell, Synapse, LineSourcePotential >>> import numpy as np >>> import matplotlib.pyplot as plt >>> # create Cell >>> cell = Cell(morphology=''.join(LFPy.__path__ + >>> ['
2021-10-15 16:01:45 2.39MB Python
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液基细胞图文报告系统.rar
2021-10-13 16:03:09 12.1MB c++11
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Cell Tracking 是一种半自动应用程序,可以通过简单的步骤跟踪活细胞成像并将其转换为感兴趣的测量特征。 首先用连续的时间点监测分割的细胞核,然后分割一些其他感兴趣的区域(扩展的细胞质)并测量其强度的动态变化。 使用“生成姐妹”模式也可以在有丝分裂事件期间添加一些新的子细胞。 跟踪过程后也可以创建单个分段细胞核或细胞的导出 VDO 文件。
2021-10-13 09:39:15 828KB matlab
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该计划是与洛桑 EPFL 的 LCSB 和 BIOp 合作开发的。 它专用于具有明场图片和 GFP 表达细胞图片的微Kong实验。 它使用井检测部分,然后使用分水岭的分割部分和使用匈牙利方法分配问题的跟踪部分。 该程序专用于实验,但用户可能有兴趣将代码的某些部分用于他们自己的程序。
2021-10-13 09:38:27 917KB matlab
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