U-Net-PyTorch实施 模型（一种流行的图像分割网络）的实现。 这是非常稳定和可配置的，我已经在多个数据集中使用了它，并将其作为几个项目的组成部分。 更新：还支持基于的3-D卷的分段 更新：所有批次归一化操作已被实例归一化所取代（以解决医学图像中的小批量），并且ReLU激活已被LeakyReLU取代，因为它在最近的工作中得到了更大的采用。 安装 您可以将此软件包安装在本地python环境中，并将其作为模块导入项目中。 将此存储库克隆到您选择的文件夹中。 cd git clone https://github.com/kilgore92/PyTorch-UNet.git 安装软件包依赖项，如下所示： cd /bin/pip install -r requirements.txt

医学影像中的机器学习--U-Net 是用于生物图像分割的卷积神经网络（CNN）。 为了保留更精细的特征图，使用了跳过连接来补充更深层中的数据。 在这项工作中，将相同的体系结构用于MRI脑部扫描，以预测一种给予另一种的方式。 这是通过将以两种不同方式扫描的原始MRI体数据切成可在网络上进行训练的2D图像来完成的。 该网络是使用 （用于CNN的MATLAB工具箱）实现的。

基于扩张神经网络（Divolved Convolutions）训练好的医疗领域的命名实体识别工具，这里主要引用模型源码，以及云部署方式供大家交流学习。 环境 阿里云服务器：Ubuntu 16.04 Python版本：3.6 Tensorflow：1.5 第一步：来一个Flask实例，并跑起来： 使用的是Pycharm创建自带的Flask项目，xxx.py from flask import Flask app = Flask(__name__) @app.route('/') def hello_world(): return 'Hello World!' if __name__ == '__main__': app.run() 执行python xxx.py就可以运行在浏览器中测试若直接在dos窗口中：输入命令也可测试。 第二部：服务器配置 服务器python版本为3.x 安装pi

共视控制 Covid Control是一种免费且可评估的机器学习模型，可预测Covid19日案例（7天移动平均值）的未来数量。 使用LSTM和强化学习对非药物干预（NPI）进行量化。 利用机器学习挽救人类史无前例的全球健康能效新型冠状病毒（COVID-19）的生命，以帮助拉平曲线。 开发数据驱动的AI系统以预测感染率并制定区域政府，社区和组织可以实施的干预计划（IP）。 当国家重新开放经济和社会时，干预计划可以减少感染病例，最大程度地减少负面经济影响，并带来更好的结果。 动机：Covid19大流行React 3Blue1Brown的“指数增长和流行病” Covid19视频： 目标是开发一种机器学习模型，以预测未来全球Covid案例的数量： Part1预测器：LSTM长短期记忆预测器模型 使用LSTM长短期记忆以最高的准确性估算未来每天发生的COVID-19病例数，并开发了一种预测器模型

医疗的 将vgg16应用到医学图像（视网膜）分类中

Pytorch-3D-医学图像语义分割 这是我的私人研究资料库的发行版。 随着研究的进行，它将进行更新。 为什么我们需要AI来进行医学图像语义分割？ 放射治疗治疗计划需要精确的轮廓，以最大程度地扩大目标覆盖范围，同时最大程度地降低对周围高风险器官（OAR）的毒性。 医师的专业知识和经验水平各异，在手动轮廓绘制过程中会引入较大的观察者内变化。 观察者之间和观察者内部的轮廓变化导致治疗计划的不确定性，这可能会损害治疗结果。 在当前的临床实践中，由医生进行手动轮廓绘制非常耗时，当患者躺在沙发上时，它无法支持自适应治疗。 例子 CT切片 地面真相 预言 更新日志 2020年7月11日更新 基本训练/验证功能 型号：更深的3D残留U-net 2020年7月13日更新 型号：3D残留U-net 数据加载器中的规范化控制 考虑引用我们的论文： Zhang，Z.，Zhao，T.，Gay，H.，Z

转换组织病理学/细胞病理学机器学习任务的助手 主流程 扫描一些WSI。 使用WSI注释工具进行一些注释。 （和 ， 现在可参见了解详情。） 然后wsiprocess帮助将WSI +注释数据转换为补丁和易于使用的注释数据。 将为您提供GUI。 有关请参见 ，以及在已修补图像和从原始WSI加载之间进行。 安装 点用户 安装或 。 有关安装提示，请参见[wiki]。 安装wsiprocess pip install wsiprocess Anaconda用户 # Only for python 3.6 or higher conda install -c tand826 wsiprocess 文献资料 例子 作为python模块 请参阅以检查流。 基本用法 import wsiprocess as wp slide = wp . slide ( "xxx.tiff" ) annot

Google-Bert模型在医疗领域的运用，实体关系三元组抽取模型（结合网上下载的两个相关模型进行修改） 该资源仅提供模型程序（无医疗相关数据）

Chinese_medical_NLP 医疗NLP领域（主要关注中文） 评测数据集 与 论文等相关资源。 9.CHIP2020各项评测已开放 10.医学数据挖掘与算法评测大赛 11.中文医疗对话数据集 12.阿里发布的中文医疗标准数据集合 中文医学知识图谱 CMeKG 英文数据集 PubMedQA: A Dataset for Biomedical Research Question Answering COMETA: A Corpus for Medical Entity Linking in the Social Media MedMentions 相关论文 1.医疗领域预训练embedding 2.综述类文章 3.电子病历相关文章 4.医学关系抽取 5.医学知识图谱 6.辅助诊断 7.ACL2020医学领域相关论文列表 8.医疗实体Linking（标准化） 9. AAAI2020

Named Entity Recognition of CEMR is provided by Yidu Cloud.本数据集由医渡云提供。 subtask2_unlabeled.txt subtask1_test.zip subtask1_train.zip subtask2_test.zip subtask2_train.zip