matlab
fcm函数代码聚类
探索聚类方法的项目
背景
该存储库包含Matei关于群集的Rmd讲座。
我还建议您下载Young
/
Old
FlowRepository数据集。
为此:
安装FlowRepositoryR软件包
使用该程序包,检索FR-FCM-ZZGS数据集
查看此git存储库中的代码,以获取有关如何进行质量控制和数据预选门的建议/指导
之后,玩得开心!
尝试FlowSOM。
考虑一下您自己的聚类和总体识别想法。
寻找在新老受试者之间差异显着的T细胞亚群。
年轻/旧数据集
该数据集由美国纽约州罗彻斯特市的David
H.
Smith疫苗生物学与免疫学中心罗彻斯特人体免疫学中心创建。
目的是使用SWIFT的竞争性聚类分配方法来测量老年人/年轻人中PBMC亚群之间的差异。
SWIFT是一种非常好的聚类方法,可在MATLAB中实现,如所述。
不幸的是,由于它是在MATLAB(这是一个可商购的系统)中实现的,因此您可能无法自己运行它。
但是,您可以将结果与已发布的SWIFT结果进行比较。
质量控制和门控
此仓库中包含三个包含我的R代码的文件。
yo_utils.R
该文件包
2022-07-19 18:10:15
11.17MB
系统开源
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