提出了一种模拟直线和弯曲周期原子结构中取向效应的模型。 已经采用了连续电位近似。 该模型允许通过笔直和弯曲的晶体操纵粒子轨迹,并控制通道粒子的强子和电磁过程横截面的缩放。 基于这种模型,开发了Geant4工具包的扩展。 该代码已针对CERN进行的渠道实验数据进行了验证。
2023-04-13 17:13:07 1.31MB Open Access
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phono3py 声子-声子相互作用相关特性的仿真包。 在可以找到Phono3py用户文档。 问题邮件列表 通常的phono3py问题应发送到phonopy邮件列表( )。 发展 phono3py的develop在github phono3py存储库的develop分支上进行管理。 Github问题是讨论phono3py问题的地方。 Github拉取请求是请求合并源代码的地方。 文献资料 Phono3py用户文档使用python sphinx编写。 源文件存储在doc目录中。 请在doc/README.md查看如何编写文档。
2023-02-24 11:13:41 5.59MB Python
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深层 一个Tensorflow DL框架,用于使用兆碱基规模的DNA序列预测Hi-C染色质相互作用。 描述 该存储库包含核心deepC python代码,R脚本和用于下游分析的功能,以及教程和示例数据的链接。 核心代码在python(v3.5 +)和tensorflow(v1)中实现。 对于下游分析和可视化,我们使用R和自定义函数来处理HiC数据和deepC预测。 要求 python 3.5 + 张量流(tensorflow-gpu) GPU支持对于预测是更可取的,对于培训来说是必不可少的 其他python模块: numpy(v1.16.4或以上) pysam(已通过v0.15.2测试) pybedtools和已安装的兼容版本的bedtools R版本3.4.4 + 套餐: tidyverse(v1.2.1或更高版本) RColorBrewer(v1.1-2或更高版本)
2023-02-12 10:22:10 20.73MB HTML
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基于多序列特征提取的蛋白质相互作用预测
2023-01-31 20:44:43 310KB 研究论文
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此脚本用于发布具有相同标题的帖子: http://www.mshalin.com/blog/?p=467 ,我试图澄清在计算 DFT(通过 FFT 算法)中所做的假设。 这些假设具有重要的后果。 此脚本以从实偶函数获得实偶傅立叶/逆傅里叶变换为例。
2023-01-31 16:45:20 4KB matlab
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采用变分原理与位力定理研究了非线性光通信系统色散补偿方案中,相邻孤子之间的相互作用对孤子传输特性的影响。结果表明:在相位匹配与等幅孤子注入时,在普通单模光纤中这两个孤子先相互吸引,而后又相互排斥,显现周期性碰撞的变化规律,形成束缚孤子态,而在色散补偿光纤中传输的孤子之间不发生碰撞;对相位不匹配与等幅孤子注入,孤子之间发生分离;对相位匹配和不等幅孤子注入,在色散补偿光纤中传输的孤子,如果初始间隔φ0越小,应注入较大的初始幅值差η0,以利于孤子的传输。
2022-12-06 11:06:47 798KB 光通信 光孤子 变分法和
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MATLAB用拟合出的代码绘图使用Logistic回归评估极端变暖与气候模式之间的相互作用 Logistic回归(LR)可​​用作检查二进制变量及其潜在协变量之间关系的实用方法。 这是一个有关如何使用MATLAB使用LR评估极端变暖和气候模式之间的相互作用的教程。 资料说明 本教程使用了三个主要数据。 1)根据HadISST数据在1950年至2018年期间的海面温度异常(Titchner and Rayner,2014)。 2)1950年至2018年的极端暖化二元指数,其中1表示相应网格中存在极端暖化,否则为0。 3)气候模式指数,包括MEI,AMO,PDO,NPGO和SAM。 型号说明 此处使用的LR的控制方程为: 其中p是极端变暖存在的概率,是SST相对于先前时间步长的变化,MEI,AMO,PDO,NPGO和SAM是相应的气候模式指标。 该等式可以转换为: 当协变量(, MEI , AMO , PDO和NPGO )增加1个单位时,相对于无极端变暖()的极端变暖概率将增加到。 分步代码 首先,我们需要加载相应的数据。 首先,我们加载SST异常。 由于github不允许太大的数据集,因
2022-10-05 10:46:23 211.81MB 系统开源
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本地QMIX 针对具有局部性假设的MARL设置的一种新的改进的DQN算法。 我们假设该问题具有一个基础的依赖关系图,该关系图连接了代理的相互作用
2022-07-28 16:37:23 4.37MB Python
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数字信号处理:第四章 信号与系统的相互作用.ppt
2022-07-12 18:06:20 4MB 数字信号处理
使用定向蠕虫算法对相互作用二聚体模型进行蒙特卡罗采样_在 Julia 中实现_julia_代码_下载
2022-06-10 09:07:06 16KB julia 算法