PyTextGCN 对TextGCN的重新实现。 此实现使用Cython进行文本到图形的转换,因此速度相当快。 图形和GCN基于库。 要求 该项目的构建具有: 的Python 3.8.5 Cython 0.29.21 CUDA 10.2(GPU支持可选) scikit学习0.23.2 pytorch 1.7.0 火炬几何1.6.3 海湾合作委员会9.3.0 nltk 3.5 scipy 1.5.2 至少Text2Graph模块也应该与这些库的其他版本一起使用。 安装 cython编译可以从项目的根目录执行: cd textgcn/lib/clib && python setup.py build_ext --inplace 用法 要从称为X的字符串列表(每个字符串包含一个文档的文本)中计算出图形,请创建名为y的标签列表以及测试索引test_idx的列表,只需运行:
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GNN、pytorch-geometric 四个包 torch_cluster scatter sparse spline_conv
2023-04-07 17:31:07 4.15MB GNN
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用于学习分子图的分层消息间传递 这是用于学习分子图的分层消息间传递的 PyTorch 实现,如我们的论文中所述: Matthias Fey、Jan-Gin Yuen、Frank Weichert:(GRL+ 2020) 要求 (>=1.4.0) (>=1.5.0) (>=1.1.0) 实验 可以通过以下方式运行实验: $ python train_zinc_subset.py $ python train_zinc_full.py $ python train_hiv.py $ python train_muv.py $ python train_tox21.py $ python train_ogbhiv.py $ python train_ogbpcba.py 引用 如果您在自己的工作中使用此代码,请引用: @inproceedings{Fey/etal/2020,
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主要邻里聚集 在PyTorch,DGL和PyTorch Geometric中实现图网的主要邻域聚合 。 概述 我们提供PyTorch,DGL和PyTorch Geometric框架中的主要邻域聚合(PNA)的实现,以及用于生成和运行多任务基准的脚本,用于运行实际基准的脚本,灵活的PyTorch GNN框架以及其他实现用于比较的模型。 该存储库的组织方式如下: models包含: pytorch包含在PyTorch中实现的各种GNN模型: 聚合器,缩放器和PNA层( pna )的实现 可以与任何类型的图卷积一起使用的灵活GNN框架( gnn_framework.py ) 本文中用于比较的其他GNN模型的实现,即GCN,GAT,GIN和MPNN dgl包含通过实现的PNA模型:聚合器,缩放器和层。 pytorch_geometric包含通过实现的PNA模型:聚合器,缩放器和图层。
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| | PyTorch几何态是时间(动态)扩展文库。 该库包含来自各种已发表研究论文的各种动态和时间几何深度学习,嵌入以及时空回归方法。此外,它还提供了易于使用的数据集加载器和迭代器,用于动态和时间图以及gpu支持。它还附带了许多带有时间和动态图的基准数据集(您也可以创建自己的数据集)。 引用 如果您发现PyTorch Geometric Temporal和新的数据集对您的研究有用,请考虑添加以下引用: @misc { pytorch_geometric_temporal , author = { Benedek, Rozemberczki and Paul, Scherer and Yixuan, He and Oliver, Kiss and Nicolas, Collignon } , title = { {PyTorch Geometric Tempor
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在本文中,我们使用一个随时间变化的图快照序列组成的时间演化图来对许多现实世界的网络进行建模。我们研究了时间演化图中的路径分类问题,该问题在实际场景中有许多应用,例如,预测电信网络中的路径故障和预测近期交通网络中的路径拥塞。 为了捕捉时间依赖性和图结构动态,我们设计了一种名为 Long Short-Term Memory R-GCN (LRGCN) 的新型深度神经网络。LRGCN 将时间相邻图快照之间的时间依赖性视为与内存的特殊关系,并使用关系 GCN 共同处理时间内和时间间关系。我们还提出了一种新的路径表示方法,称为自注意路径嵌入(SAPE),将任意长度的路径嵌入到固定长度的向量中。通过在加利福尼亚的真实电信网络和交通网络上的实验,我们证明了 LRGCN 在路径故障预测方面相对于其他竞争方法的优越性,并证明了 SAPE 在路径表示上的有效性。
2021-08-31 13:16:30 10.88MB 路径嵌入