VCS:registered:是一个高性能、高容量的Verilog:registered:模拟器，它将高级抽象验证技术集成到一个开放的本地平台中。
VCS是一个编译后的代码模拟器。
它使您能够分析、编译和模拟Verilog、SystemVerilog、OpenVera和SystemC设计描述。
它还提供了一组仿真和调试特性来验证您的设计。
这些特性提供了源代码级调试和仿真结果查看的功能。
VCS通过提供用于RTL功能验证的最快和最高容量的Verilog仿真来加速完成系统验证。
2022-05-05 10:26:03
7.55MB
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瓦吉诺
用于全基因组测序数据和大型SNP数据库的Fase SNP基因分型工具。
从Bioconda安装
可以使用命令conda install vargeno从Bioconda conda install vargeno 。
请转到以获取有关Bioconda的更多信息。
如果您尚未 ，则可以 。
快速使用
VarGeno作为输入：
FASTA文件格式的参考基因组序列。
以VCF文件格式进行基因分型的SNP列表。
以FASTQ文件格式从供体基因组测序测序。
在对个体进行基因分型之前，必须使用以下命令为参考和SNP列表构建索引：
vargeno index ref.fa snp.vc
2021-11-06 12:07:32
21.67MB
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vcf2phylip
将VCF格式的SNP转换为PHYLIP，NEXUS，二进制NEXUS或FASTA比对以进行系统发育分析
简要描述;简介
该脚本以VCF文件作为输入，并将使用SNP基因型创建PHYLIP（松弛版本），FASTA，NEXUS或二进制NEXUS格式的系统发育分析矩阵。 对于杂合SNP，已达成共识，并将IUPAC核苷酸歧义码写入最终矩阵（ces），允许任何倍性水平并自动检测。 该代码针对大型VCF矩阵（数百个样本和数百万个基因型）进行了优化，例如，在我们的测试中，它在约27分钟内处理了20GB VCF（约300万个SNP x 650个个体）。 该脚本的初始版本仅产生了PHYLIP矩阵，但现在我们添加了其他流行的格式，包括使用BEAST中的SNAPP插件运行SNP分析的二进制NEXUS文件（仅适用于二倍体基因型）。
此外，您可以为每个SNP选择最少数量的样本，以控制丢失数
2021-10-25 20:50:51
20KB
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snps pciephy 28nmhpc完整的datasheet，用于学习pcie phy的相关知识
2021-10-05 19:01:30
4.54MB
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