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UVM/VCS
SNPS
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VCS:registered:是一个高性能、高容量的Verilog:registered:模拟器,它将高级抽象验证技术集成到一个开放的本地平台中。 VCS是一个编译后的代码模拟器。 它使您能够分析、编译和模拟Verilog、SystemVerilog、OpenVera和SystemC设计描述。 它还提供了一组仿真和调试特性来验证您的设计。 这些特性提供了源代码级调试和仿真结果查看的功能。 VCS通过提供用于RTL功能验证的最快和最高容量的Verilog仿真来加速完成系统验证。
2022-05-05 10:26:03
7.55MB
UVM/VCS
SNPS
1
vargeno:从全基因组测序数据中快速准确地进行SNP基因分型,以进行床边诊断-源码
瓦吉诺 用于全基因组测序数据和大型SNP数据库的Fase SNP基因分型工具。 从Bioconda安装 可以使用命令conda install vargeno从Bioconda conda install vargeno 。 请转到以获取有关Bioconda的更多信息。 如果您尚未 ,则可以 。 快速使用 VarGeno作为输入: FASTA文件格式的参考基因组序列。 以VCF文件格式进行基因分型的SNP列表。 以FASTQ文件格式从供体基因组测序测序。 在对个体进行基因分型之前,必须使用以下命令为参考和SNP列表构建索引: vargeno index ref.fa snp.vc
2021-11-06 12:07:32
21.67MB
bioinformatics
snps
algorithms
computational-biology
1
vcf2phylip:将VCF格式的SNP转换为PHYLIP,NEXUS,二进制NEXUS或FASTA比对以进行系统发育分析-源码
vcf2phylip 将VCF格式的SNP转换为PHYLIP,NEXUS,二进制NEXUS或FASTA比对以进行系统发育分析 简要描述;简介 该脚本以VCF文件作为输入,并将使用SNP基因型创建PHYLIP(松弛版本),FASTA,NEXUS或二进制NEXUS格式的系统发育分析矩阵。 对于杂合SNP,已达成共识,并将IUPAC核苷酸歧义码写入最终矩阵(ces),允许任何倍性水平并自动检测。 该代码针对大型VCF矩阵(数百个样本和数百万个基因型)进行了优化,例如,在我们的测试中,它在约27分钟内处理了20GB VCF(约300万个SNP x 650个个体)。 该脚本的初始版本仅产生了PHYLIP矩阵,但现在我们添加了其他流行的格式,包括使用BEAST中的SNAPP插件运行SNP分析的二进制NEXUS文件(仅适用于二倍体基因型)。 此外,您可以为每个SNP选择最少数量的样本,以控制丢失数
2021-10-25 20:50:51
20KB
snps
binary
nexus
vcf
1
snps
pciephy 28nmhpc datasheet
snps
pciephy 28nmhpc完整的datasheet,用于学习pcie phy的相关知识
2021-10-05 19:01:30
4.54MB
pcie
1
基于JAVA WEB的
SNPs
分析平台的开发.pdf
基于JAVA WEB的
SNPs
分析平台的开发.pdf
2021-07-02 22:03:06
637KB
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