rnaseq_variant_calling_workflow 下载 使用以下命令克隆git存储库: git clone https://github.com/durrantmm/rnaseq_variant_calling_workflow.git 安装 此工作流使用conda环境来满足所有必要的依赖关系。 确保您已安装anaconda。 下载。 您只需输入以下内容就可以安装工作流程: bash install.sh 在您的控制台中。 现在是时候进行配置了。 配置 这是正确运行工作流程中非常重要的一步。 打开提供的config.yaml文件以开始使用 设置GATK和Picard执行路径 config.yaml文件的前两个参数是 gatk_path: "java -jar /path/to/GenomeAnalysisTK.jar" picard_path: "java -jar
2023-04-23 16:56:04 9KB Python
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DEN0028E-SMC-Calling-Convention-1.4eac0
2023-01-04 14:00:50 764KB 安全
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解决的问题: 现象: 如果SAP服务端是2022年最新的7700版本(实施商的说法,实际是否最新有待证实);通过NuGet或网上找的一下DLL库都太老了,在一切配置都正常的情况下调用repository.CreateFunction("接口名")时报错误: SAP.Middleware.Connector.RfcCommunicationException:“destination XXXX failed when calling RFC_METADATA_GET -- see log for details” 猜测的原因: 老的DLL库在获取接口实例时,会触发“RFC_METADATA_GET”,7700版本的SAP可能没有了这个函数。 解决的办法: 升级sapnco的SDK。附件是2022.07发布的SDK,直接替换即可使用。亲测.net4.0-4.8的版本均可正常使用。 环境配置: 1、版本 3.0.25.0 for .NET v4.0 on x64/x86 2、发布时间:2022.07 3、对应SAP版本:7700
2022-08-23 18:07:43 6.83MB sap sapnco RFC_METADATA_GET RfcCommunication
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19455 IMS Video Calling over LTE Test Plan 15.xlsx
2022-07-13 13:09:39 150KB 考试
SNP_calling_GATK 这是运行GATK调用高质量SNP的逐步步骤,它旨在在集群上运行。 该脚本是通过实施Genome Analysis Toolkit(GATK)而构成的全基因组植物SNP调用管道的一部分。 有关GATK的更多信息,请访问: ://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us 可以在github中找到此管道的详细说明: : 作者:Taslima Haque 上次修改时间:2021年2月12日 请将您的查询发送给作者: 或 它期望什么? 这是每个脚本的示例标头,它们期望跟随变量: refDir = / work / 02786 / taslima / dbs / PH#参考基因组文件所在的参考目录 ref = PhalliiHAL_496_v2.0.softmasked.fa#参考基因组文件的名称 outDir = / scratch
2022-03-19 10:06:22 38KB Shell
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The dataset is from 2020 China Hualu Data Lake Algorithm Competition hosted by China Hualu Group Co., Ltd.. It is not for commercial use.本数据集来源于2020年中国华录杯·数据湖算法大赛,由北京易华录信息技术股份有限公司提供,不得用于任何商业用途。 calling image.jpg smoking and calling image_datasets.zip
2021-07-27 09:13:18 115.63MB 数据集
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Best practices for evaluating variant calling methods for microbial
2021-07-23 14:01:48 2.1MB SNP microbial practices methods
2018-A review of somatic single nucleotide variant calling algorithms for NGS
2021-07-21 19:06:13 653KB SNP somatic
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使用GATK进行 SNP Callling的自动化流程。基于GATK3.3以上版本的HaplotypeCaller标准流程进行,测试脚本以sra文件为最初输入,将读取文件见内的所有sra文件(视为同一个样本的数据),进行SNP Calling产生GVCF,然后用户可自行进行jointCall
2019-12-21 22:10:15 7KB GATK SNAP Calling
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