cellpose:一种用于细胞分割的通用算法-源码

上传者: 42138780 | 上传时间: 2021-11-25 16:14:03 | 文件大小: 12.67MB | 文件类型: -
细胞姿态 细胞和细胞核分割的通用算法。 这段代码是由 Carsen Stringer 和 Marius Pachitariu 编写的。 要了解 Cellpose,请阅读或观看演讲。 如需支持,请打开一个问题。 如果您想为自己和其他人改进 Cellpose,请考虑通过内置 GUI 界面为您的一些图像提供手动分割(请参阅下面的说明)。 更新 v0.6(2020 年 12 月) Pytorch 现在是 cellpose 的默认深度神经网络软件。 仍将支持 Mxnet。 要安装 mxnet (CPU),请运行pip install mxnet-mkl 。 要在笔记本中使用 mxnet,请在创建模型时声明torch=False ,例如model = models.Cellpose(torch=False) 。 要在命令行上使用 mxnet,请添加标志--mxnet ,例如python -m

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