基于蛋白质相互作用的药物敏感性预测模型,张乃千,,综合利用多种基因组学数据预测抗癌药物的敏感性,以指导临床用药是精准医疗的核心目标之一。目前,针对药物敏感性预测问题的研究
2021-10-31 13:55:05 747KB 首发论文
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利用互信息和传递熵评估HRV神经系统的副交感和交感活动之间的相互作用
2021-10-30 16:15:07 1.62MB 研究论文
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该软件包实现了所提出的 EEG 连接方法,如下所示: A. Omidvarnia、G. Azemi、B. Boashash、JO Toole、P. Colditz 和 S. Vanhatalo, “测量头皮 EEG 信号中随时间变化的信息流:正交部分定向连贯性,”IEEE 生物医学工程汇刊,2013 年 [Epub 印刷前] (可在: http : //ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?arnumber=6637060 获得)。 该包使用以下外部工具箱: 1. ARFIT工具箱,可从以下网站获得: http ://www.clidyn.ethz.ch/arfit/index.html BioSig工具箱(可从http://biosig.sourceforge.net获得)也非常鼓舞人心,对这项工作很有帮助。 %%%%%%%%%%%
2021-10-26 19:26:52 1.02MB matlab
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DFT的matlab源代码 描述 TB2J是一个开源python程序包,用于从DFT计算Heisenberg模型中的磁相互作用参数。 它使用磁力定理并以格林函数方法中的局部刚性自旋旋转作为扰动。 功能包括: 计算海森堡模型中的参数,包括各向同性交换,各向异性交换,Dyzanoshinskii-Moriya相互作用。 可以与Wannier90一起使用来自许多DFT代码的输入,例如Abinit,Quantum Espresso,Siesta,VASP等。 可以将DFT代码的输入与Siesta的数字轨道一起使用。 根据海森堡哈密顿量计算磁振子能带结构。 生成自旋动力学/蒙特卡洛代码MULTIBINIT的输入。 仅需要基态DFT计算。 无需超级电池。 计算远距离的磁性相互作用。 最少的用户输入,允许像体验和自动工作流程这样的黑匣子。 输入端(DFT哈密顿量)和输出端(海森堡模型)均具有多功能API。 有关更多信息,请参阅以下文档: 依存关系 python(经过ver 3.6测试) 麻木 科学的 ASE(原子模拟环境) matplotlib(可选),如果您想直接绘制磁振子能带结构。 sisl(可
2021-10-19 16:31:20 2.11MB 系统开源
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[Re]决策过程中认知和运动皮质-基底神经节循环之间的相互作用:一项计算研究,M。Topalidou和NP Rougier,Re Science ,2015年。 决策过程中认知和运动皮质-基底神经节循环之间相互作用的参考实现:计算研究,M。Guthrie,A。Leblois,A。Garenne和T. Boraud,《神经生理学杂志》,2013年,第109页。 关键字:神经科学,基底神经节,Python
2021-10-18 04:57:48 294KB Python
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使用链接单元算法,因此,计算成本与原子数呈线性关系。 可以选择激活周期性边界条件。 应该定义一个三次区域来生成邻居列表。 原子坐标只能是 3D 格式,作为行向量。 % [nebrTab, nebrLen] = md_neighlist_cube(x, nx, rc, srgdat, bctyp, frc)% % ------------------------------------------------- --------------------- % 为立方体 % 区域中的原子系统创建邻居列表% WZ。 单%------------------------------------------------- --------------- % 输入: % x : 原子坐标,[ px, py, pz] % nx : 数量。 原子数,= size( x, 1) % rc : 截止
2021-10-12 13:41:09 3KB matlab
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ProLIF 文献资料 讲解 CI 聚酰亚胺 执照 描述 ProLIF(蛋白质-配体相互作用指纹图谱)是一种工具,用于生成用于从分子动力学轨迹和对接模拟中提取的蛋白质-配体和蛋白质-蛋白质相互作用相互作用指纹。 它还支持DNA配体,DNA蛋白质和DNA-DNA相互作用。 您可以在上进行任何安装之前尝试一下。 文献资料 可在在线找到安装说明,文档和教程。 问题 如果发现错误,请在页面上打开一个问题。 讨论 如果您对如何使用ProLIF有疑问,或者想提供反馈或分享想法和新功能,请前往页面。 引用ProLIF 请参考文档上的。 执照 除非另有说明,否则此目录和所有子目录中的所有文件均根据Apache License 2.0版分发 Copyright 2017-2021 Cédric BOUYSSET Licensed under the Apache License, Versi
2021-10-11 10:36:26 4.92MB molecular-dynamics docking rdkit chemoinformatics
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蛋白质-配体相互作用分析仪(PLIP) 轻松分析3D结构中的非共价蛋白-配体相互作用。 用例 码头工人 奇点 Python模块 “我想分析我的蛋白质-配体复合物!” :check_mark: :check_mark: :yellow_circle: :cross_mark: “我想分析十亿个蛋白质-配体复合物!” :cross_mark: :yellow_circle: :check_mark: :yellow_circle: “我喜欢Linux命令行,并希望围绕PLIP构建工作流程!” :cross_mark: :check_mark: :check_mark: :yellow_circle: “我是一名Python程序员,想在我的项目中使用PLIP!” :cross_mark: :yellow_circle: :yellow_circle: :check_mark: 快速开始 码头工人 如果已安装Docker,则可以使用以下shell命令对结构1vsn运行PLIP分析: 在Linux / MacOS上:
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该程序为激光与物质相互作用的双温度模型程序。能够为科研人员提供便利(激光与物质相互作用的温度场分布)。其描述了激光与物质作用时材料表面电子、晶格温度随时间的变化,以及温度场与深度的关系等。
2021-10-10 14:28:01 3KB 双温度模型 激光 物质
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蛋白质相互作用及其网络预测方法研究进展
2021-09-27 17:26:33 446KB 研究论文
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