分子动力学的邻居列表构建例程：此例程返回 3D 空间中给定原子集的相互作用对。-matlab开发

使用链接单元算法，因此，计算成本与原子数呈线性关系。 可以选择激活周期性边界条件。 应该定义一个三次区域来生成邻居列表。 原子坐标只能是 3D 格式，作为行向量。 % [nebrTab, nebrLen] = md_neighlist_cube(x, nx, rc, srgdat, bctyp, frc)% % ------------------------------------------------- --------------------- % 为立方体 % 区域中的原子系统创建邻居列表% WZ。 单%------------------------------------------------- --------------- ％ 输入： % x : 原子坐标，[ px, py, pz] % nx : 数量。 原子数，= size( x, 1) % rc : 截止