## Malsite-Deep Malsite-Deep：基于NearMiss-2策略的深度学习和多信息融合预测蛋白质丙二酸化位点 ### Malsite-Deep使用以下依赖项： Python 3.6 麻木 科学的 scikit学习 大熊猫 TensorFlow 凯拉斯 ###指导原则：**数据集文件包含五类数据集，其中包含训练数据集和独立测试数据集。 **特征提取： PseAAC.py是PseAAC的实现。 exchange_matrix.m和be_extract_feature是BE的实现。 Bi_profile_bayes.m是BPB的实现。 DPC.py是实施DC的实现。 EBGW_DATA.m和EBGW.m是EBGW的实现。 BLOSUM62.py是BLOSUM62的实现。 EAAC.py是EAAC的实现。 PWAA_Y1.m是PWAA的实现。 **

HLC-723G8全自动糖化血红蛋白分析仪的中文使用说明书。 第 1 章、前言 1、 1 概要……………………………….…………………………………………………………P1-1 第 2 章、使用之前须知 2、 1 零部件的检查…………………………………………………………….…………………P2-2 2、 2 仪器的构成………………………………………………………………………………….P2-5 2、 3 各部分的名称和作用………….……………………………………………………………P2-7 2、 4 设置地点…………….…….…………………………………….…………………………P2-13 2、 5 连接………………..….……………………………………………………………………P2-18 2、 6 柱………...…………………………………………………………………………………P2-23 第 3 章、测定操作 3、 1 测定的原理…………………………………………………………….…………………P3-1 3、 2 接通电源……………………………………………………………………………………P3-2 3、 3 测定的流程………………………………………………………………….………………P3-8 3、 4 了解仪器的工作状态………………………………………………………...……………P3-10 3、 5 测定前的确认事项………..……………………………………………….………………P3-16 3、 6 校准………………………………………………………………………………………P3-21 3、 7 试样………………………………………………………………………………………P3-29 3、 8 测定的开始和结束………………………………………………………………………P3-39 3、 9 消除错误…………………………………………………………………………………P3-42 3、 10 紧急试样的测定（STAT） ……………………………………………………………... P3-44 3、 11 利用 POWER 键关闭电源操作…………………………………..……………………P3-47 3、 12 测定结果的看法…………………………………………………………………..……P3-48 3、 13 清单数据…………………………………………………………..……………………P-3-55 第 4 章、画面操作 4、 1 主画面……………………………………………………………………………… P4-1 4、 2 STAT………………………………………………………………………………P4-4 4、 3 维护………………………………………………………………………………… P4-6 4 、 4 试 剂 更 换 … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … . P 4 - 7 4、 5 菜单………………………………………………………………………………… P4-8 4、 6 参数设定…………………………………………………………………………P4-9 4、 7 存储卡……………………………………………………………………………… P4-18 4、 8 保存数据的一览表………………………………………………………………P4-21 4、 9 被保存的测定结果的确认、重算、向主机再次传送……………………… P4-23 4、 10 日期、时间的设定和一周定时的设定………………………………………….. P4-25 I4、 11 清单数据显示和条形码的编辑…………………………………………………... P4-27 4、 12 应用程序………………………………………………………………………P4-29 4、 13 数据通信的设定………………………………..……………………………………P4-30 4、 14 密码输入（参数初始化） …………………………………………………………P4-32 4、 15 参数的打印……………………………………………………………………P4-33 4、 16 注解行的设定…………………………………………………………………P4-34 4、 17 记录文件的确认………………………………………………………………P4-35 4、 18 结果判定参数的设定…………………………………………………………..P4-37 4、 19 条型码读取器的设定和读取检查………………………..……………………….P4-42 第 5 章、日常的维护保养管理 5、 1 每天的保养和管理………………………………………………………………P5-1 5、 2 维护保养检查项目………………………………………………………………P5-2 5、 3 洗脱液、溶血清洗液的更换……………………………………………………P5-4 5、 4 洗脱液的注入……………………………………………………………………P5-8 5、 5 泵的排气…………………………………………………………………………P5-10 5、 6 柱的更换…………………………………………………………………………P5-13 5、 7 过滤器的更换……………………………………………………………………P5-16 5、 8 打印纸的更换……………………………………………………………………P5-19 5、 9 吸管过滤器的更换………………………………………………………………P5-21 5、 10 采样针的更换………………………………………………………………… P5-22 5、 11 针清洗部件 O 型环的更换…………………………………………………….P5-25 第 6 章、故障检修 6、 1 在测定中的注意事项……………………………………………………………..P6-1 6、 2 故障时要确认的事项………………………………………………………………….P6-3 6、 3 错误信息……………………………………………………………………….…..P6-6 6、 4 异常色谱………………………………………………………………………P6-22 第 7 章、附录 7、 1 从软盘读取文件…………………..………………………………………………….P7-1 7、 2 与主计算机之间的通信………………………………………………………………… P7-6. 7、 3 主机的设计规格…………………………………………………………….………… P7-10

目的蛋白相互作用 目的蛋白蛋白质关系提取 下载AIMed数据集 从ftp://ftp.cs.utexas.edu/pub/mooney/bio-data/interactions.tar.gz下载 使用说明将原始数据集转换为XML convert_aimed.py -i aimed_interactions_input_dir -o aimed.xml 跑 步骤1：将xml AIMed转换为扁平化的json python src/preprocessors/aimed_json_converter.py --inputfile tests/sample_data/aimed.xml --outputfile aimed.json

NGL Viewer是用于分子可视化的Web应用程序。 用于显示具有各种表示形式的分子，如蛋白质和DNA / RNA。 实际观看： 说明文件： 特征 分子结构（mmCIF，PDB，PQR，GRO，SDF，MOL2，MMTF） 密度体积（MRC / MAP / CCP4，DX / DXBIN，CUBE，BRIX / DSN6，XPLOR / CNS） 用户交互（鼠标挑选，选择语言，动画，图像导出） 坐标轨迹（DCD和PSF，NCTRAJ和PRMTOP，TRR / XTC和TOP，通过MDSrv进行远程访问） 可嵌入的（单个文件，API） 用法 由于NGL Viewer是要在Web浏览器中查看的一组静态文件，因此不需要太多安装。 出于开发目的，克隆此存储库并在本地提供服务将很有帮助（请参见下文）。 将NGL Viewer嵌入为库时，包含自包含的build dist / ngl.j

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