EpigenomicsBioconductor:R脚本使用AnnotationHub包获取有关人类CpG岛和组蛋白修饰(H3K4me3和H3K27me3)的数据; 和GenomicRanges软件包从数据中提取有关表观基因组的基本统计信息

上传者: 42164685 | 上传时间: 2022-10-05 13:19:50 | 文件大小: 3KB | 文件类型: ZIP
R
表观基因组学生物导体 背景:我为名为“基因组数据科学的生物导体”的Coursera课程的第一个作业编写了名为“ HW1.R”的R脚本。 关于: R脚本使用AnnotationHub程序包获取有关人类CpG岛和组蛋白修饰(H3K4me3和H3K27me3)的数据。 R脚本使用GenomicRanges程序包通过执行以下操作来从数据中提取基本统计信息:按染色体分组范围,子集,相交,查找范围重叠,调整范围大小,创建列联表以及计算优势比。 软件: R版本4.0.4(2021-02-15)。 生物导体版本3.12。 AnnotationHub。 基因组范围。 rtracklayer。

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[{"title":"( 3 个子文件 3KB ) EpigenomicsBioconductor:R脚本使用AnnotationHub包获取有关人类CpG岛和组蛋白修饰(H3K4me3和H3K27me3)的数据; 和GenomicRanges软件包从数据中提取有关表观基因组的基本统计信息","children":[{"title":"EpigenomicsBioconductor-main","children":[{"title":"HW1.R <span style='color:#111;'> 6.07KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"README.md <span style='color:#111;'> 716B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"LICENSE.txt.txt <span style='color:#111;'> 28B </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}],"spread":true}]

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