基于Markov亲和力的细胞图插补(MAGIC)
基于马尔可夫亲和力的细胞图插补(MAGIC)是一种用于对最常应用于单细胞RNA测序数据的高维数据进行去噪的算法。 MAGIC使用结果图对特征进行平滑处理并恢复数据的结构,从而学习流形数据。
要了解如何将MAGIC应用于单细胞RNA序列,阐明上皮到间充质的转变,请阅读的。
MAGIC已在Python,Matlab和R中实现。
要立即开始,请查看我们的教程:
Python
骨髓教程
[R
上皮到间质过渡教程
骨髓教程
魔术揭示了波形蛋白(VIM),钙黏着蛋白1(CDH1)和锌指结合E-box的同源盒1(ZEB1,由颜色编码)之间的相互作用。
目录
Python
安装
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用法
快速开始
讲解
Matlab的Matlab版本的说明
[R
安装
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从GitHub安装
用法
快速开
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