垫基因组 机器学习应用于“材料基因组”的材料物理学。
2021-11-17 19:37:03 18.83MB Python
1
bioinformatics is useful for computation and algorithms, as well as programming
2021-11-12 04:38:12 8.55MB bioinformatics
1
RepBaseRepeatMaskerEdition-20170127.tar.gz
2021-11-08 22:43:45 48.84MB genome repeat repeatmask software
1
MAKER2_PM_genome_annotation 使用MAKER2注释四个DICOT PM基因组 参考 & 软件与数据 软件先决条件: 具有所有依赖项(我使用NCBI BLAST)和RepBase(使用的版本为20150807)的RepeatModeler(1.0.4)和RepeatMasker(4.0.5)。 MAKER 2.31.9版(尽管其他任何版本2发行版也可以)。 奥古斯都版本3.3。 BUSCO版本3。 SNAP BEDtools版本2.24.0 原始数据/资源: 1:基因组支架: > Genome.fa:使用CLCbio从头组装参考基因组。 Ambiguous trim = Yes Ambiguous limit = 2 Quality trim = Yes Quality lim
2021-09-25 14:11:11 4KB Perl
1
信息安全_数据安全_Securing the Genome The Intersec 应急响应 AI 法律法规 安全人才 信息安全研究
2021-08-22 17:00:13 3.53MB 漏洞分析 企业安全 安全实践 系统安全
2018-PacBio Technology and Application .pdf
2021-08-04 14:04:05 10.14MB pacbio genome assmebly 10x
大基因denovo.pdf
2021-08-04 14:04:04 29.63MB 动植物基因组 genome assembly
##自述## 用于创建病毒和宏基因组数据库的软件程序/工具 作者:Sanjeev Kulshreshtha ( ) 日期:08/15/2011 ##为什么选择这个程序?## 有必要在 JCVI 创建一个数据库,用于系统发育分析与 umbrealla APIS 整合所需的宏基因组序列JCVI 的数据库进行比较分析。 ##这个程序有什么作用?## 该软件程序自动创建一个包含病毒基因组的数据库和微生物宏基因组表达序列数据来自各种公共生物数据库。 可以使用 SQL 查询查看数据库GUI 界面或直接在 Unix、linux 或 PC 内核上。 ##这个程序是如何运作的?## 该程序提取、解析并生成加载 int 的最终数据数据库。 使用预先定义的标准处理和验证数据之前传输到数据库。 只有当公布的肽段数据和它自己的翻译后的肽序列数据匹配,然后只加载数据数据库。 该程序使用的数据库架构和格
2021-06-21 18:10:38 14KB Perl
1
基因组多义词和同义词 版权所有 :copyright: 2015,威斯康星大学董事会。 仅授予非营利用途的使用权。 Genome Polysemy and Synonymy (GPS) 是一个可视化平台,用于分析光学图谱、光学重叠群和从序列数据创建的计算机限制图谱之间的比对。
2021-06-11 11:06:19 811KB Java
1
基因组组装 此存储库包含我的一些脚本,这些脚本是我在密歇根州立大学基因组学、进化和开发实验室的实验室轮换期间编写的 惊人的双孢鹅膏菌基因组计划 是世界上毒性最强的真菌之一,因为它的环肽能抑制 RNA 聚合酶 II。 这种聚合酶的抑制会影响蛋白质合成,这可能是致命的。 组装和注释的基因组将对研究这种真菌有很大帮助。 这个基因组的组装有几个问题。 这种真菌是双核的,所以每个细胞都有两个细胞核。 目前尚不清楚基因组内容如何在这些细胞核之间分布。 这种真菌不能在实验室培养。 所以所有的组织都是在自然界收集的,这意味着测序材料在某种程度上受到了污染。 像大多数真菌一样,我们必须处理重复和重叠的编码区域。 我必须处理的另一个大问题是我自己。 我是一名本科生,受过训练的分子生物学家,从未在信息学或生物信息学领域工作过。 我可以访问两个基因组组装(Illumina 数据、 和 )和一个转录组组装
2021-06-07 20:03:17 14KB Python
1