MAKER2_PM_genome_annotation:使用MAKER2注释四个DICOT PM基因组-源码
MAKER2_PM_genome_annotation
使用MAKER2注释四个DICOT PM基因组
参考
＆
软件与数据
软件先决条件：
具有所有依赖项（我使用NCBI BLAST）和RepBase（使用的版本为20150807）的RepeatModeler（1.0.4）和RepeatMasker（4.0.5）。
MAKER 2.31.9版（尽管其他任何版本2发行版也可以）。
奥古斯都版本3.3。
BUSCO版本3。
SNAP
BEDtools版本2.24.0
原始数据/资源：
1：基因组支架：
> Genome.fa：使用CLCbio从头组装参考基因组。
Ambiguous trim = Yes
Ambiguous limit = 2
Quality trim = Yes
Quality lim
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