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Krait：微卫星研究和引物设计 目录 介绍 Krait是一款功能强大且超快速的工具，具有用户友好的图形界面，可用于全基因组范围内的微卫星研究，从而试图克服当前可用工具的局限性。 Krait用Python编写，可以在Windows，Linux或Mac系统上作为独立的桌面应用程序运行而无需依赖。 微卫星搜索引擎用C编写，并编译为Python模块，以导入到Krait中 特征 确定完美的SSR 识别不完善的SSR（iSSR） 化合物SSR（cSSR）的鉴定 从超大型基因组中鉴定VNTR 在基因编码区定位SSR 微卫星设计入门 统计分析和绘图 支持gzip压缩的fasta作为输入文件 支持导出FASTA，GFF3或CSV 从NCBI数据库下载DNA序列 下载 https://github.com/lmdu/krait/releases 文献资料 http://krait.bios

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Chapter 1. Introduction Section 1.1. Why Linux? Section 1.2. Embedded Linux Today Section 1.3. Open Source and the GPL Section 1.4. Standards and Relevant Bodies Section 1.5. Chapter Summary Chapter 2. Your First Embedded Experience Section 2.1. Embedded or Not? Section 2.2. Anatomy of an Embedded System Section 2.3. Storage Considerations Section 2.4. Embedded Linux Distributions Section 2.5. Chapter Summary Chapter 3. Processor Basics Section 3.1. Stand-alone Processors Section 3.2. Integrated Processors: Systems on Chip Section 3.3. Hardware Platforms Section 3.4. Chapter Summary Chapter 4. The Linux KernelA Different Perspective Section 4.1. Background Section 4.2. Linux Kernel Construction Section 4.3. Kernel Build System Section 4.4. Obtaining a Linux Kernel Section 4.5. Chapter Summary Chapter 5. Kernel Initialization Section 5.1. Composite Kernel Image: Piggy and Friends Section 5.2. Initialization Flow of Control Section 5.3. Kernel Command Line Processing Section 5.4. Subsystem Initialization Section 5.5. The init Thread Section 5.6. Chapter Summary Chapter 6. System Initialization Section 6.1. Root File System Section 6.2. Kernel's Last Boot Steps Section 6.3. The Init Process Section 6.4. Initial RAM Disk Section 6.5. Using initramfs Section 6.6. Shutdown Section 6.7. Chapter Summary Chapter 7. Bootloaders Section 7.1. Role of a Bootloader Section 7.2. Bootloader Challenges Section 7.3. A Universal Bootloader: Das U-Boot Section 7.4. Porting U-Boot Section 7.5. Other Bootloaders Section 7.6. Chapter Summary Chapter 8. Device Driver Basics Section 8.1. Device Driver Concepts Section 8.2. Module Utilities Section 8.3. Driver Methods Section 8.4. Bringing It All Together Section 8.5. Device Drivers and the GPL Section 8.6. Chapter Summary Chapter 9. File Systems Section 9.1. Linux File System Concepts Section 9.2. ext2 Section 9.3. ext3 Section 9.4. ReiserFS Section 9.5. JFFS2 Section 9.6. cramfs Section 9.7. Network File System Section 9.8. Pseudo File Sys