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上传时间: 2021-11-09 21:44:16
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文件大小: 26.62MB
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文件类型: -
Krait:微卫星研究和引物设计
目录
介绍
Krait是一款功能强大且超快速的工具,具有用户友好的图形界面,可用于全基因组范围内的微卫星研究,从而试图克服当前可用工具的局限性。 Krait用Python编写,可以在Windows,Linux或Mac系统上作为独立的桌面应用程序运行而无需依赖。 微卫星搜索引擎用C编写,并编译为Python模块,以导入到Krait中
特征
确定完美的SSR
识别不完善的SSR(iSSR)
化合物SSR(cSSR)的鉴定
从超大型基因组中鉴定VNTR
在基因编码区定位SSR
微卫星设计入门
统计分析和绘图
支持gzip压缩的fasta作为输入文件
支持导出FASTA,GFF3或CSV
从NCBI数据库下载DNA序列
下载
https://github.com/lmdu/krait/releases
文献资料
http://krait.bios