用Perl编写的生物信息学工具 这里的大多数脚本是在我从事不同项目时编写的,我认为这对其他人将很有用,并且可以根据需要进行扩展/修改。 IO ::常规 脚本使用自定义 Perl模块。 请通过浏览目录查看安装说明。 如果要安装lncRNApipe Pipeline,则会自动安装IO::Routine模块。 需要Bio::SeqIO模块已安装且可用。 nc lncRNA管道 从头开始提取推定的新型lncRNA的管道,其中提供了从深度测序数据(例如:RNA-Seq)和注释数据组装而成的GTF格式的转录本列表。 转到目录以获取脚本列表。 安装lncRNApipe及其所有依赖项(Mac和
2024-04-11 16:13:10 325.53MB bioinformatics pipeline perl mirna
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本书配套资源包括电子课件PPT、习题答案、习题参考代码、测试数据共4部分。 信息学奥林匹克竞赛是受各级各类学校重视、受青少年学生欢迎的计算机编程类竞赛活动。本书以Dev-C++为语言载体,以“程序=算法+数据结构”为教学主线,以“应用+实战”为背景目的,以“单元—课”为基本结构,每一课包括学习目标、知识讲解和实践巩固,配以完备的参考程序、习题解答和测试数据,通过细致、规范的分析讲解,举一反三、学以致用,培养学生良好的计算思维。全书分为10个单元,共计81课。本书由具有丰富的中小学程序设计教学经验的一线教师编写,适合作为中小学程序设计教学和信息学奥林匹克竞赛(NOI)的专用教材,也可作为大学生程序设计比赛(ACM)及程序设计爱好者的学习参考书。
2024-04-02 12:36:46 160.69MB 电子课件 奥林匹克竞赛
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C++在信息学竞赛中应用
虽然我们总是习惯写“C/C++”,其实大家都知道C与C++是两种不同的语言:C++是C的“超集”——它“几乎”完全兼容C的语法,同时也提供非常多特有的语法与概念。
本文并不想全面介绍C++的语法与概念——那足够写一本一寸多厚的专业书籍——只是将信息学竞赛中可能要用到的C++语法做个简要介绍,它们的加入将使您原有的C程序更简洁、清晰,书写更方便。
2024-01-20 16:56:51 50KB 信息学竞赛
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信息学奥赛零基础起步的课件资源,用于信息学奥赛培训基础知识的讲解。只有跟信息学相关的部分。
2024-01-20 16:37:31 7.76MB 信息学奥赛 C++语言
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乌根 下载UGENE: ://ugeneunipro.github.io/ugene/ 建筑UGENE 先决条件 确保已安装Qt(> = 5.4.2和<= 5.15)开发库: 我们强烈建议您使用Qt在线安装程序将Qt安装到任何操作系统上。 这是Windows和macOS操作系统(也适用于Linux)的主要方式。 要安装Qt,请从Qt官方网站( )下载在线安装程序。 确保已安装以下组件: Qt Prebuild组件 Qt脚本 安装Qt的其他选项: Ubuntu> = 14.04:`sudo apt-get install qt5-default qttools5-dev-tools qtscript5-dev libqt5svg5-dev Ubuntu 12.04: 下载并安装Qt 5.5.1: 设置系统变量:export PATH = $ PATH:〜/ Qt5.5.1 / 5.5 / gcc_64 / bin sudo apt-get install g++ libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev Fedora: sudo yum ins
2024-01-12 16:27:58 27.73MB science workflow bioinformatics cross-platform
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脂蛋白是从家畜衍生的过敏原之一,对过敏反应的发展具有临床重要性。 它们在不同的动物中都有特征。 具有致敏能力的特征,对于涉及过敏反应的表位知之甚少。 在这里,通过生物信息学工具探索了脂蛋白之间交叉反应的潜在抗原区域。 通过系统发育研究,使用了来自不同家畜(小鼠,狗,猫,公牛,仓鼠,马和猪)的几种脂蛋白的氨基酸序列来确定亲缘关系。 通过使用MEGA软件获得具有最高系统发育关系的组。 通过同源性对未在蛋白质数据库中报告的脂蛋白的3D模型进行建模,以识别在这组过敏原的交叉反应性中受损的潜在抗原区域。 变应性脂蛋白的整个数据库和推断的最大似然树的比对将脂蛋白分为五个单系进化枝(此处称为A,B,C,D和E)。 根据多重配对分析,C组(Fel d 4,R​​at n 1和Equ c 1)在其氨基酸序列中显示出最高的同一性(58%)。 对保守和暴露残基的分析表明,C组共有三个抗原性区域,可能会促进其交叉反应。 确定了潜在的抗原性位点,用于在本研究中分析的不同脂钙蛋白之间产生交叉反应。 这些研究支持进行定向诱变测试以确认其与脂蛋白的致敏能力的相关性的需要。
2024-01-11 17:37:42 3.33MB 生物信息学
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河豚白细胞介素-2基因鉴定及其生物信息学分析,董伟仁,邵健忠, 利用比较基因组学方法,在河豚(Takifugu rubripes)基因组中鉴定了IL-2基因(FrIL-2)。该基因为单拷贝基因,由4个外显子和3个内含子组成
2024-01-11 08:58:23 344KB 首发论文
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该书从基因、RNA、蛋白质、表观遗传学四个方面介绍计算生物学和生物信息学知识、案例。作者是Ka-Chun Wong。该电子书文字可复制。
2024-01-10 15:10:38 7.38MB 计算生物学 生物信息学 表观遗传学
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小菜蛾肽聚糖识别蛋白的生物信息学分析,梁昊,黄斌,肽聚糖识别蛋白参与生物体的免疫过程,在昆虫抵抗病原菌入侵和免疫信号通路中具有非常重要的作用。为了深入研究小菜蛾(Plutella xyl
2024-01-10 13:28:36 533KB 首发论文
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信息学奥赛(C语言)-试题及答案整理\1995年第1届全国青少年信息学奥林匹克联赛普及组初赛答案.doc
2023-11-18 22:58:34 44KB 奥赛试题
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