基于多模态机器学习的膝关节骨关节炎进展的平原X线片和临床数据预测。 纸张代码和预先训练的模型。 Arxiv预印本: ://arxiv.org/abs/1904.06236 (c)奥卢大学Aleksei Tiulpin,2018-2019年。 关于 该存储库包含完整的代码,可重现本文中的培训过程。 要从头开始训练模型,您需要从MOST和OAI数据集中获取DICOM图像。 您还需要获取相应的元数据(可从网站下载。中提供了有关获取数据的更多说明。可在找到注释这些图像所需的元数据。 安装,培训和评估 依存关系 为了运行该项目,我们使用了Ubuntu 16.04 , Docker和nvidia-docker 。 这些是您唯一需要的软件依赖项。 请安装这些就可以了。 如果不想使用Docker ,则可以按照给定的Dockerfile遵循安装过程。 我们使用3xGTX1080Ti NVIDIA
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PyTorch VAE 在pytorch中实现的变体自动编码器(VAE)的集合,着重于可重复性。 该项目的目的是为其中许多很酷的VAE模型提供一个快速简单的工作示例。 所有模型都在上进行了训练,以一致性和比较性。 所有模型的架构在相同的层上都保持尽可能相似,除非原始论文需要根本不同的架构(例如,VQ VAE使用残差层,不使用批处理规范,这与其他模型不同)。 这是每个模型的。 要求 Python> = 3.5 PyTorch> = 1.3 Pytorch Lightning> = 0.6.0( ) 启用CUDA的计算设备 安装 $ git clone https://github.co
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通过双向LSTM-CNNs-CRF教程进行端到端序列标签 这是针对ACL'16论文的PyTorch教程 该存储库包括 资料夹 设置说明文件 预训练模型目录(笔记本电脑将根据需要自动将预训练模型下载到此目录中) 作者 安装 最好的安装pytorch的方法是通过 设置 创建新的Conda环境 conda create -n pytorch python=3.5 激活公寓环境 source activate pytorch 使用特定的python版本(python 3.5)设置笔记本 conda install notebook ipykernel ipython kernel install --user PyTorch安装命令: conda install pytorch torchvision -c pytorch NumPy安装 conda install -c anaco
2021-09-13 10:31:31 34.06MB nlp tutorial deep-learning reproducible-research
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使用CK JSON API统一预测分析 所有CK组件都可以在和! 该项目由托管。 这是一个存储库,其中包含CK模块和操作,以使用我们的标准CK JSON API统一对不同预测性分析框架(scipy,R,DNN)的访问。 社区使用它来研究工作流程/管道,以实现协作,可重用和可再现的实验。 见我们最近的文章中了解更多详情: , 。 更多信息: 作者 贡献者 查看贡献者列表 带操作的共享CK模块 建议 实验 实验原始 实验视图 图形 图点 笔记本 数学条件 数学前沿 数学变化 模型 模型图像分类 模型 模型 模型种类 模型 报告 桌子 安装 首先按照此处所述安装CK框架。 然后按如下所示安装此CK存储库: $ ck pull repo:ck-analytics $ ck list ck-analytics:module:* 依存关系 Python: matplot
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FMA:音乐分析数据集 , , , 。 国际音乐信息检索学会会议(ISMIR),2017年。 我们介绍了免费音乐档案(FMA),这是一个开放的且易于访问的数据集,适用于评估MIR中的多个任务,MIR是与浏览,搜索和组织大型音乐收藏有关的领域。 但是,社区对功能和端到端学习的兴趣日益增长,这受到大型音频数据集可用性有限的限制。 FMA旨在克服这一障碍,以161个流派的分级分类法,提供来自16,341位艺术家和14,854张专辑的106,574条曲目的917 GiB和343天的Creative Commons许可音频。 它提供全长和高质量的音频,预先计算的功能,以及轨道和用户级别的元数据
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贝叶斯神经网络 以下近似推理方法的Pytorch实现: 我们还提供以下代码: 先决条件 火炬 脾气暴躁的 Matplotlib 该项目是用python 2.7和Pytorch 1.0.1编写的。 如果CUDA可用,它将自动使用。 这些模型也不会太大,因此也可以在CPU上运行。 用法 结构体 回归实验 我们对用 生成的玩具数据集和真实数据(六个)进行了均方差和异方差回归实验。 Notebooks / classification /(ModelName)_(ExperimentType).ipynb :包含在(ExperimentType)上使用(ModelName)进行的实验,即同调/异
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rmdTemplates:包含Rmarkdown模板集合的R包
2021-02-06 09:05:32 294KB r reproducible-research rstudio rmarkdown
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在Jupyter笔记本中编写和共享计算分析的十个简单规则 该存储库是对 及其预印本 浏览以下示例笔记本,了解十个简单规则的应用。 此外,我们还建立了以众包更多技术和深入的教程,并紧跟快速发展的Jupyter生态系统。 我们鼓励您贡献并分享您的专业知识。 例子1 本示例演示了使用机器学习方法预测蛋白质折叠分类的可重现的4步工作流程。 规则9:设计笔记本以供阅读,运行和浏览。 下面的nbviewer链接提供笔记本电脑和笔记本电脑的非交互式预览。 按钮使用Binder( )服务器在Web浏览器中启动Jupyter Notebook或Jupyter Lab(可能很慢!)。 (请参阅Binder网站如何设置到Git存储库的链接。)HTML链接提供了笔记本的永久静态记录。 也可以从0-Workflow.ipynb顶级笔记本中的链接直接启动所有笔记本。 Nbviewer Jupyter笔记本 Jupyter实验室 HTML 规则8:共享和解释您的数据。 为了实现可重复性,我们提供了example1 / data目录,其中包含运行工作流程所需的所有数据。 该数据与下载位置和下载日期
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