【生物信息学】是生物学与计算机科学的交叉领域，它利用计算机技术和算法来解析和理解生物数据，包括基因序列、蛋白质结构、代谢途径等。在本讲义中，我们将深入探讨这一前沿领域的核心概念和应用。 【Coursera】是一个全球知名的在线学习平台，提供各类课程，包括世界顶级大学的课程。此讲义源自北京大学在Coursera上开设的生物信息学课程，旨在为学习者提供系统性的知识和实践指导。 【北京大学】作为中国顶级学府，其生物信息学课程具有权威性和深度，涵盖了从基础理论到实际分析技术的广泛内容。通过这些讲义，学生能够掌握生物信息学的基础知识，并能进行实际的数据分析。 【PPT】（PowerPoint演示文稿）是教学中常用的教学辅助工具，用于呈现课程内容、讲解概念和案例。本讲义的PPT包含了14个章节，每个章节可能涵盖一个或多个主题，如基因组学、转录组学、蛋白质组学、进化分析、生物数据库查询等。 在第一章中，可能会介绍生物信息学的基本定义和历史，阐述该学科的发展背景和重要性。接下来的章节可能涉及生物数据的获取，如高通量测序技术，以及这些数据的预处理步骤。 第二章至第四章，可能会详细讲解基因组学，包括DNA序列比对、基因预测和基因家族分析。这些章节会介绍基本的算法，如Smith-Waterman和BLAST，以及如何使用软件工具如FASTA和BEDTools。 第五章至第七章可能涉及转录组学，介绍RNA-seq数据分析，包括质量控制、组装、表达量估计和差异表达分析。可能会提及DESeq2、edgeR等统计方法。 第八章至第十章，我们可能看到蛋白质组学的内容，包括蛋白质序列分析、结构预测和功能注释。会讲解结构比对工具，如TM-align，以及功能预测软件，如InterProScan。 第十一章和第十二章，可能会探讨系统生物学和网络分析，介绍如何构建和分析生物网络，比如代谢网络和蛋白质相互作用网络，以及使用Cytoscape等工具。 第十三章和第十四章，可能会涉及进化的生物信息学，讲解分子进化理论，如基于模型的进化树构建，以及物种进化和种群遗传学的分析。 这个PPT讲义提供了全面的生物信息学知识框架，对于想在这个领域深造或需要处理生物数据的科研人员来说，是一份宝贵的资源。通过学习，不仅可以理解生物信息学的基本原理，还能掌握实际操作技能，为未来的研究打下坚实的基础。

Coursera-Getting-and-Cleaning-Data-Course-Project 此存储库托管数据科学跟踪课程“获取和清理数据”的 R 代码和文档文件，在coursera 中可用。 该代码将所有数据都存在于同一文件夹中，未压缩且未更改名称。 CodeBook.md 描述了变量、数据以及为清理数据而执行的任何转换或工作。 run_analysis.R 包含执行 5 个步骤中描述的分析的所有代码。 只需导入文件即可在 RStudio 中启动它们。 第 5 步的输出称为means_data.txt，它以课程项目的形式上传。 介绍 脚本 run_analysis.R 执行课程项目定义中描述的 5 个步骤。 使用 rbind() 函数合并所有相似的数据（匹配维度）。 然后，仅从整个数据集中提取具有均值和标准差度量的那些列。 为此，我们在 features.txt 上使

《科学写作》是由Dr. Kristin Sainani博士制作并提供的Coursera最新课程的课件，主要聚焦于科学领域的论文写作技巧。该课程通过一系列的PPT讲义，涵盖了多个关键主题，旨在帮助学生和科研工作者提升撰写高质量科研文章的能力。 "04_7-4-grants-iii_Module_7.4_slides_Research_Plan.pdf"这一部分可能涉及到的是如何制定科研计划。在撰写科研申请或项目提案时，研究计划是至关重要的一环。这部分可能会讲解如何清晰地阐述研究目标、方法、预期结果和潜在影响，以及如何有效地组织这些信息来吸引资助者的注意力。 "01_8-1-talking-with-the-media_Unit_8_slides.pdf"可能关注的是科学家与媒体的沟通技巧。在科学传播日益重要的今天，了解如何与媒体交流，将科研成果准确、生动地传达给公众，是科研工作者必备的技能。这部分可能会讨论如何准备媒体采访，如何简洁明了地解释复杂的科学概念，以及如何应对可能的误解和争议。 "06_8-6-social-media_Social_media_v.2.pdf"则可能涉及科学信息在社交媒体上的传播。随着社交媒体的发展，科研人员也需要学会利用这些平台来分享研究成果，扩大影响力。这部分可能涵盖如何建立专业的网络形象，如何发布吸引人的科学内容，以及如何处理网络互动和反馈。 "01_5-1-tables-and-figures_Unit_5_slides.pdf"可能深入探讨了论文中的图表设计。在科学论文中，图表是数据呈现的关键方式，能够直观地展示研究结果。这部分可能教导如何创建清晰、有效的图表，遵循科学出版的规范，以及如何利用图表增强文章的可读性。 "03_7-3-grants-ii_2017_Specific_Aims_V2_1.pdf"可能专注于科研基金申请中的具体目标设定。明确、具有吸引力的具体目标是获得资助的关键。这部分可能讲解如何撰写出有说服力的目标，包括背景介绍、研究问题、目标陈述和预期成果。 "02_7-2-grants-i_Getting_Started_Writing_GrantsV2.pdf"可能是关于启动基金申请写作的指南，包括如何寻找合适的资助机会，如何构建有力的论据，以及如何组织申请材料。 "05_8-5-interviewing-a-scientist_Interviewing.pdf"可能涵盖了对科学家进行访谈的技巧，这对于科研合作或者新闻报道都是重要的。这部分可能讨论如何准备面试，如何提问以获取深入的信息，以及如何记录和整理访谈内容。 "04_7-4-grants-iii_Module_7.4_slides_full_page.pdf"和"01_1-1-introduction-principles-of-effective-writing_Unit_1_slides.pdf"以及"01_4-1-more-paragraph-practice_Unit_4_slides.pdf"可能分别是更详尽的研究计划介绍，写作基本原则的入门教学，以及段落写作的进一步练习，旨在提升写作的整体质量和连贯性。 这个课程全面覆盖了科学写作的不同方面，从最初的科研计划制定，到最终的论文发表，以及中间的基金申请、媒体沟通、社交媒体策略等，为科研工作者提供了一个全方位的学习资源。通过学习这些内容，学员将能更好地理解和实践科学写作的核心原则，提升自己的科研表达能力。

Coursera-Python-数据结构-密歇根大学-

#R 编程 我对 Coursera 上课程作业的解决方案。 [Week 1](./Week 1) -没有编程作业，只包含用于解决测验的数据集 [Week 2](./Week 2) - 编程作业（空气污染） [第 3 周](./第 3 周) - 编程赋值（缓存矩阵的逆） [第 4 周](./第 4 周) - 笔记和编程作业（医院质量）

网络爬虫 用于获取 Coursera、EdX 和 Udacity 数据的爬虫程序 要求 Python 2.7 具有以下库： 刮痧 要求 JSON 运行爬虫 Coursera 要从 Coursera 收集数据，请运行： python coursera/scrape_coursera.py edX 要从 edX 收集数据，请导航到edx/目录并运行： scrapy crawl edx 优达学城 要从 Udacity 收集数据，请导航到udacity/目录并运行： scrapy crawl udacity

webgl_assignments 使用WebGL Coursera课程进行交互式计算机图形学的作业提交。

机器学习数学 该存储库包含伦敦帝国学院Coursera上针对“机器学习的数学”专业的所有测验/作业。 可以看到我的证明证明。 注意：此存储库中提供的材料仅用于帮助那些可能在课程中的任何时间卡住的人。 强烈建议没有人可以复制此处介绍的解决方案（Coursera Honor Code的验证）。 更新 课程1：线性代数-已完成 第1周-已完成第2周-已完成第3周-已完成第4周-已完成第5周-已完成 课程2：多元演算-已完成 第1周-已完成第2周-已完成第3周-已完成第4周-已完成第5周-已完成第6周-已完成 课程3：PCA-已完成 第1周-已完成第2周-已完成第3周-已完成第4周-已完成

神经网络实现分类matlab代码Cousera_MarchineLearning 这是 Andrew Ng 制作的在线课程 Machine Learning 的笔记本。 内容以“周”分隔，并在文件名后面注明了一个关键思想。 Week_1：优化线性回归模型的 θs：[1] Gradient Descent ； [2]正规方程； Week_2：梯度下降和正态方程的正则化方法； Week_3：分类模型 Week_4：神经网络 在每个文件中，有： LectureNote.md：本周课堂笔记； Script_intro.md：方法在脚本中是如何实现的，并附有实例以及与MATLAB内置函数的结果对比 Method.m：代码实现。