地黄饮子对转基因果蝇AD模型mTOR信号通路中4E结合蛋白和p70核糖体S6蛋白激酶表达的影响，关慧波，刘莹，目的：研究地黄饮子对转Tau基因果蝇mTOR信号通路中4E结合蛋白(4E-BP)和p70核糖体S6蛋白激酶(p70S6K)表达的影响，探讨其防治阿尔茨海默病的�

matlab资源分配的代码Nat-Commun-2018 该存储库包含用于在我们的论文“正交核糖体的动态分配促进共表达基因解偶联”中生成结果的 MATLAB 代码示例 接触 请通过 Github 联系 Alexander Darlington 以获取与此代码相关的查询。 抽象的 将合成回路引入微生物会在回路和宿主基因之间产生对共享细胞资源（如核糖体）的竞争。 这可能导致不同电路基因表达之间出现不需要的耦合，使设计过程复杂化并可能导致电路故障。 通过表达特异性改变的合成 16S rRNA，我们可以将核糖体池划分为宿主特异性和电路特异性活性。 我们在数学和实验上表明，可以通过将基因定位到不同的核糖体库来减轻资源竞争的影响。 这种分工可用于增加通过代谢途径的流量。 我们开发了一个细胞生理学模型，该模型能够捕获这些观察结果并使用它来设计动态资源分配控制器。 实施后，随着合成电路对翻译资源的需求增加，该控制器通过增加正交核糖体的产生来解耦基因。 参考 Alexander PS Darlington、Juhyun Kim、José I. Jiménez 和 Declan G. Bates “正交核

丰富的资源会促进细菌的生长，特别是富营养型细菌的生长。快速的生长需要大量的核糖体，富营养性细菌会持有更多的核糖体RNA操纵子（number of ribosomal RNA operons, rrn）。我们可以根据核糖体RNA操纵子的数目来对寡营养型和富营养型细菌进行区分，而且核糖体RNA操纵子的数目在16srRNA序列上保守，因此我们可以通过分类信息对核糖体RNA操纵子数进行预测,进而对其生活史策略进行推断。

第6章之细胞质基质核糖体内膜系统资料.ppt

核糖华尔兹 用于计算最佳 P 位点偏移、诊断分析和核糖体分析数据目视检查的 R 包 目录 去除重复读取 读取长度的选择 注释数据表 P位偏移 密码子和 CDS 覆盖 密码子覆盖 CDS覆盖 图形输出 笔记 数据概览 每个区域的 P 站点 三核苷酸周期 元图 密码子使用 联系人 概述 核糖体分析是一种强大的技术，用于研究全基因组水平的翻译，生成有关核糖体沿 RNA 位置的独特信息。 核糖体的最佳定位需要正确识别每个核糖体保护片段中的核糖体 P 位点，这是确定翻译核糖体的三核苷酸周期性并得出关于核糖体所在位置的正确结论的关键步骤。 为了以核苷酸分辨率确定核糖体足迹内的 P 位点，需要精确估计其相对于受保护片段的偏移量。 riboWaltz是一个 R 包，用于计算最佳 P 位点偏移、诊断分析和核糖体分析数据的目视检查。 利用两步算法，其中偏移信息通过不同长度的读取群体传递，以最大化偏移一致性

维基百科关于16S RNA的中文解释，因维基百科被和谐，在此分享。