riboWaltz:核糖体分析数据中核糖体 P 位点定位的优化-源码

核糖华尔兹 用于计算最佳 P 位点偏移、诊断分析和核糖体分析数据目视检查的 R 包 目录 去除重复读取 读取长度的选择 注释数据表 P位偏移 密码子和 CDS 覆盖 密码子覆盖 CDS覆盖 图形输出 笔记 数据概览 每个区域的 P 站点 三核苷酸周期 元图 密码子使用 联系人 概述 核糖体分析是一种强大的技术，用于研究全基因组水平的翻译，生成有关核糖体沿 RNA 位置的独特信息。 核糖体的最佳定位需要正确识别每个核糖体保护片段中的核糖体 P 位点，这是确定翻译核糖体的三核苷酸周期性并得出关于核糖体所在位置的正确结论的关键步骤。 为了以核苷酸分辨率确定核糖体足迹内的 P 位点，需要精确估计其相对于受保护片段的偏移量。 riboWaltz是一个 R 包，用于计算最佳 P 位点偏移、诊断分析和核糖体分析数据的目视检查。 利用两步算法，其中偏移信息通过不同长度的读取群体传递，以最大化偏移一致性