cpup:将mpileup格式转换为基本计数tsv表
cpup
将samtools mpileup结果转换为基本计数tsv
支持多个bam文件
如果不与标签（ -t AD ， -t ADF ， -t ADR ）混淆，则bcftools mpileup可能是一个更好的选择。
samtools mpileup可以按以下格式逐站点汇总映射结果。 第5列（第8列，第11列，第14列...）报告了每个站点中观察到的碱基。
XII 455422 C 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF
XII 455423 T 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF
XII 455424 C 17 <<<<<<<<<<<<<<,,^$, FFFFFFFFFFFFFFFFE 4 <<,, FFFF
XII 455425 A 18 <<<<<<<<<
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[{"title":"（ 9 个子文件 378KB ） cpup:将mpileup格式转换为基本计数tsv表","children":[{"title":"cpup-main","children":[{"title":"test","children":[{"title":"sample2.bam <span style='color:#111;'> 7.74KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"yeast.bed <span style='color:#111;'> 36B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"sample1.bam <span style='color:#111;'> 58.34KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"yeast.fa <span style='color:#111;'> 1.03MB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"yeast.fa.fai <span style='color:#111;'> 31B </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true},{"title":"cpup.cpp <span style='color:#111;'> 10.35KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":".gitignore <span style='color:#111;'> 24B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"Makefile <span style='color:#111;'> 270B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"README.md <span style='color:#111;'> 1.89KB </span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}],"spread":true}]
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