cpup 将samtools mpileup结果转换为基本计数tsv 支持多个bam文件 如果不与标签( -t AD , -t ADF , -t ADR )混淆,则bcftools mpileup可能是一个更好的选择。 samtools mpileup可以按以下格式逐站点汇总映射结果。 第5列(第8列,第11列,第14列...)报告了每个站点中观察到的碱基。 XII 455422 C 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF XII 455423 T 16 <<<<<<<<<<<<<<,, FFFFFFFFFFFFFFFF 4 <<,, FFFF XII 455424 C 17 <<<<<<<<<<<<<<,,^$, FFFFFFFFFFFFFFFFE 4 <<,, FFFF XII 455425 A 18 <<<<<<<<<
2022-05-12 19:08:26 378KB bioinformatics mutations samtools snp-genotyping
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