YeastpRofile:用于计算酵母mRNA的TSS和TTS周围特征的软件-开源
YeastpRofile是一个用C＃编写的便携式Windows窗体应用程序，用于计算酵母mRNA的转录起始（TSS）和终止（TTS）位点周围的基因组变量的概况。 通过计算转录链递增移动时基因组变量值与TSS（或TTS）计数之间的全基因组范围Pearson相关系数（R），可以获取该图谱。 用于计算剖面的TSS和TTS计数数据取自Pelechano等人的工作。 （1）。 输入文件必须是基于酵母基因组序列版本R64的BedGraph格式的文件。 输出文件是文本制表符分隔的表，该表报告了变量坐标相对于TSS或TTS的各种偏移的R值。 还报道了与每条链相关的R，以验证在两个转录方向上均获得了相似的谱。 1）V.Pelechano，W.Wei，LM Steinmetz，《异构体图谱揭示的广泛转录异质性》，《自然》（Nature），497（2013）127-13。
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