immunedeconv:免疫解卷积方法的统一接口（CIBERSORT，EPIC，quanTIseq，TIMER，xCell，MCPcounter）-源码

一个R包，用于统一访问从大量RNA测序数据估算免疫细胞组分的计算方法。 基本用法 immunedeconv :: deconvolute( gene_expression_matrix , " quantiseq " ) 其中gene_expression_matrix是一个矩阵，其中的基因排成行，样本的列成列。 行名必须是符号，而列名必须是样本名称。 该方法可以是以下方法之一 quantiseq timer cibersort cibersort_abs mcp_counter xcell epic 有关更详细的使用说明，请参阅文档： 。 。 可用方法，许可，引用 请注意，尽管immunedeconv本身是免费的（ ），但您可能需要获得使用单个方法的许可证。 有关更多信息，请参见下表。 如果您在工作中使用此程序包，请同时引用我们的程序包和使用的方法。 Sturm，G.，Fino