Python-force-field-parameterization-workflow:这是一个 Python 软件包,旨在提供一种系统且可重复的方法来参数化分子力场

上传者: 42097967 | 上传时间: 2022-05-17 10:08:48 | 文件大小: 653.22MB | 文件类型: ZIP
一种数据驱动的方法来系统地和可重复地优化力场参数 特征: 有效采用并行性以使用并行模拟器执行采样 所选模拟器支持的力场功能形式的多种选择 灵活包含不同物理特性作为参考数据 模块化设计,方便用户自定义扩展: 客观函数形式 采样方法/力场势函数形式 优化算法 所需软件: 一个编译好的 MD/MC 包可执行(已经支持 LAMMPS) Slurm 工作负载管理器(或同等产品) Python 3.7 其他 Python 库:pytest==5.4.2、numpy==1.18.1 英特尔 Fortran 编译器(> 18.0.3 版)。 gfortran (4.8.5) 也能成功编译,但程序可能无法使用长绝对文件路径。 在 Linux 上安装: conda 是推荐的包管理器。 如果未找到“conda”或需要 root 权限,您可以将 anaconda: ://www.anaconda

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