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SpotsInNucleiBot:用于计算原子核中点源(点)的机器人。-matlab开发
SpotsInNucleiBot:用于计算原子核中点源(点)的机器人。-matlab开发
上传者:
38743119
|
上传时间: 2021-05-29 21:02:47
|
文件大小: 38KB
|
文件类型: ZIP
matlab
依赖性:此机器人需要 Bioformats 才能读取 tiff 堆栈。 从下载http://downloads.openmicroscopy.org/bio-formats/5.3.4/ 并将其添加到 Matlab 的路径中。 要使用此机器人,请在Matlab的提示下执行“ spotsInNucleiBot”,然后按照选项/说明进行操作。 输入格式:图像栈,即多通道图像。 渠道之一用于检测原子核,其他包含衍射极限点(点源)。 输出格式:对于分析的每个堆栈,包含每个原子核的点源计数的表格。 有两种算法可用于检测原子核(简单阈值和机器学习), 和两个检测点(LoG 和高级 LoG)。 机器学习算法需要训练模型以分割核。 要训练此类模型,请使用 nucleiSegmentationBot(在 NucleiSegmentationBot 下)。 ----- 关于 'LoG' 和 '
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