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上传时间: 2021-11-06 21:41:03
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Matlab代码考克斯预测神经母细胞瘤总体生存的转移机制模型
此代码生成该论文中报告的结果和数字:
Benzekry,S.,Sentis,C.,Coze,C.,Tessonnier,L.,&André,N.(2020年)。
使用转移的机械模型开发和验证高危神经母细胞瘤总体存活率的预测模型。
JCO:《临床癌症信息学》,第5卷,第81-90页。
具体来说,该代码由python和matlab脚本以及jupyter笔记本(在python和R中)组成,并执行:
总体生存和无进展生存的预后因素的统计分析(Kaplan-Meier,对数秩,Cox回归)
code/statistical_analysis.ipynb
结果导出到statistical_analysis/
转移机制模型的仿真
code/main_simulate.m
诊断时根据定量临床数据对模型参数进行校准:原发肿瘤大小,乳酸脱氢酶(LDH)和核显像的SIOPEN评分
code/mechanistic.ipynb
结果以mechanistic/导出mechanistic/
评估基于特定患者的Cox回归模型对整体生存的预测能力
code