上传者: 38638004
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上传时间: 2021-12-26 15:39:38
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文件大小: 43KB
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文件类型: -
去噪声代码matlab
医院级神经影像数据的预处理
这是用于各种神经成像预处理操作(注册,切片,去噪,分割等)的MATLAB代码,其最初旨在处理常规临床数据(因此而得名)[1]。
它以nifti文件(如.nii或.nii.gz)作为输入,并生成此数据的副本,并对其应用了所需的预处理步骤。
它还使用成对的标签遮罩(例如,T1w
MRI和肿瘤遮罩(或多个类别))处理图像数据,并确保生成的预处理数据是一致的。
请参阅下面的示例用例,这些用例可以独立运行,也可以启发更复杂的预处理任务。
有关更多详细信息,请参阅。
依存关系
该算法要求以下软件包位于MATLAB路径上:
SPM12:从下载。
spm_superres:从中下载/克隆(如果要使用降噪或超分辨率选项)。
用例范例
1.多通道MRI分割
该MATLAB代码段将多个序列的MR图像作为输入,并生成已被共同注册和切片的图像。
然后使用SPM12统一分段例程对这些图像进行分段,并将本机+模板(未调制)空间GM,WM和CSF分段写入磁盘。
%
Paths
to
multi-channel
images
paths
=
{'MRI_T1w.nii