matlab中AIC代码及实例合成生物学中优化设计的模型选择
这里提供了用于生成,分析和可视化本文中提供的数据的脚本。
使用脚本需要RStan软件包,该软件包可在以下链接获得:
以及使用贝叶斯优化程序包的链接:
对于Matlab工具箱AMIGO2,请参考:
贝叶斯案例的数据组织在以下子文件夹(Bayesian_MS目录)中:
推理:
ODE_Model1.stan是由Lugagne等人发布的带有模型1(M1)的stan统计模型脚本,用于对来自[1]的实验数据进行贝叶斯推断。
ODE_Model2.stan
,带有模型2(M2)的stan统计模型脚本,用于对来自[1]的实验数据进行贝叶斯推断。
ODE_Model3.stan
,带有模型3(M3)的stan统计模型脚本,用于对来自[1]的实验数据进行贝叶斯推断。
MultiExtractExp.R脚本,用于访问[1]中的实验数据和实验方案,以在推理之前生成要传递给stan模型的适当对象列表。
使用脚本DataExtraction.m生成csv文件。
DataExtraction.m脚本,用于从[1]中提取所需的实验数据和实验配置文件。
m
2023-03-12 22:25:23
19.67MB
系统开源
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