目的蛋白相互作用
目的蛋白蛋白质关系提取
下载AIMed数据集
从ftp://ftp.cs.utexas.edu/pub/mooney/bio-data/interactions.tar.gz下载
使用说明将原始数据集转换为XML
convert_aimed.py -i aimed_interactions_input_dir -o aimed.xml
跑
步骤1：将xml AIMed转换为扁平化的json
python src/preprocessors/aimed_json_converter.py --inputfile tests/sample_data/aimed.xml --outputfile aimed.json
2022-05-16 22:11:04
25KB
1
NGL Viewer是用于分子可视化的Web应用程序。 用于显示具有各种表示形式的分子，如蛋白质和DNA / RNA。
实际观看：
说明文件：
特征
分子结构（mmCIF，PDB，PQR，GRO，SDF，MOL2，MMTF）
密度体积（MRC / MAP / CCP4，DX / DXBIN，CUBE，BRIX / DSN6，XPLOR / CNS）
用户交互（鼠标挑选，选择语言，动画，图像导出）
坐标轨迹（DCD和PSF，NCTRAJ和PRMTOP，TRR / XTC和TOP，通过MDSrv进行远程访问）
可嵌入的（单个文件，API）
用法
由于NGL Viewer是要在Web浏览器中查看的一组静态文件，因此不需要太多安装。 出于开发目的，克隆此存储库并在本地提供服务将很有帮助（请参见下文）。 将NGL Viewer嵌入为库时，包含自包含的build dist / ngl.j
2022-05-12 14:14:45
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