转录组范围内对经典或替代性活化巨噬细胞的分析
概括
下一代测序(NGS)彻底改变了基于系统的细胞途径分析。 这项研究的目的是比较NGS衍生的人类M1和M2样巨噬细胞分析(RNA-seq)与微阵列和定量逆转录聚合酶链React(qRT-PCR)方法,并建立人类巨噬细胞的高分辨率转录组。
从经典和其他活化的人类巨噬细胞中分离总RNA.mRNA谱图是通过使用Illumina HiSeqSQ对3个供体的M1和M2巨噬细胞进行深度测序而生成的。 通过两种方法在转录亚型水平上分析了通过质量过滤器的序列读数:Casava1.8和TopHat,然后进行袖扣连接。 使用LightCycler和SYBR Green分析法进行qRT-PCR验证。
标题
geo_accession
source_name_ch1
有机体_ch1
跑步
SRA_样本
cell_type
团体
M1_1
M1_1
G
2021-12-01 20:56:54
5.79MB
HTML
1