Bioinformatics algorithms : techniques and applications
2022-03-20 16:19:40
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用于化合物和蛋白质建模的深度学习库DTI，药物特性，PPI，DDI，蛋白质功能预测
在药物再利用，虚拟筛选，QSAR，副作用预测等方面的应用
该存储库托管DeepPurpose，DeepPurpose是一个基于深度学习的分子建模和预测工具包，可用于药物-目标相互作用预测，化合物特性预测，蛋白质-蛋白质相互作用预测和蛋白质功能预测（使用PyTorch）。 我们专注于DTI及其在药物再利用和虚拟筛选中的应用，但支持其他各种分子编码任务。 它允许非常简单的用法（仅几行代码），以促进用于生命科学研究的深度学习。
消息！
[05/21] 0.1.2支持5种新的基于图神经网络的复合编码模型（DGL_GCN，DGL_NeuralFP，DGL_GIN_AttrMasking，DGL_GIN_ContextPred，DGL_AttentiveFP），使用！ 提供一个例子！
[12/20] TDC数据
2022-03-13 00:08:41
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Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。
Cytoscape 源自系统生物学，用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起，其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。
2022-02-15 19:08:30
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