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上传时间: 2022-03-13 00:08:41
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文件大小: 11.1MB
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用于化合物和蛋白质建模的深度学习库DTI,药物特性,PPI,DDI,蛋白质功能预测
在药物再利用,虚拟筛选,QSAR,副作用预测等方面的应用
该存储库托管DeepPurpose,DeepPurpose是一个基于深度学习的分子建模和预测工具包,可用于药物-目标相互作用预测,化合物特性预测,蛋白质-蛋白质相互作用预测和蛋白质功能预测(使用PyTorch)。 我们专注于DTI及其在药物再利用和虚拟筛选中的应用,但支持其他各种分子编码任务。 它允许非常简单的用法(仅几行代码),以促进用于生命科学研究的深度学习。
消息!
[05/21] 0.1.2支持5种新的基于图神经网络的复合编码模型(DGL_GCN,DGL_NeuralFP,DGL_GIN_AttrMasking,DGL_GIN_ContextPred,DGL_AttentiveFP),使用! 提供一个例子!
[12/20] TDC数据