嗝 HiC分析以推断染色体间和染色体内的相互作用。 HiCUP的用户指南非常简单。 从HiCUP获得bam输出后，就可以使用GOTHiC_for_HiCUP文件夹中的脚本来分析输出。

层次分析matlab代码贝叶斯流行 贝叶斯推断人口患病率。 该软件包包括用于实现贝叶斯流行度推断的Matlab，Python和R的代码，如下所述： 人口患病率的贝叶斯推断RAA Ince，JW Kay和PG Schyns biorxiv： 考虑在心理学或神经影像学实验中的每个参与者，或在电生理学实验中记录的每个单个单元上执行统计测试（具有常见的假阳性率α）。 经过此第一级分析，我们可以仅使用三个数字来计算总体中此类测试的阳性结果阳性率的贝叶斯估计：测试总数n ，其中k为阳性，假阳性率（alpha） a 。 这些数字可以直接在函数调用中指定，也可以从表示在第一级应用各个测试的结果的变量中获取。 example_csv脚本提供了一个示例，该示例加载此第一级参与者内部有效数据并应用第二级患病率函数。 bayesprev_example.{m,R,py}在分层正态模型下模拟数据，在第一级上对每个参与者内的零进行t检验，在第二级上应用贝叶斯流行率推断。 用户可以调整此示例以加载自己的原始数据，将t检验替换为任何其他参与参与者的统计检验，或者直接加载指标变量的重要性并应用第二级检验（另请参见exa

高中化学思维导图_无机推断.pdf

高中化学思维导图_有机推断和有机合成.pdf

回归树matlab代码GENIE3 基于机器学习的方法，可根据表达数据推断基因调控网络。 GENIE3方法在以下论文中描述（可用）： Huynh-Thu V. A., Irrthum A., Wehenkel L., and Geurts P. Inferring regulatory networks from expression data using tree-based methods. PLoS ONE, 5(9):e12776, 2019. GENIE3的四个实现可用：Python，MATLAB，R / randomForest和R / C。 每个文件夹都包含一个PDF文件，其中包含有关如何运行代码的分步教程。 注1：R / C实现也可以从安装。 注2： PLoS ONE论文中介绍的所有结果都是使用MATLAB实现生成的。 GENIE3基于回归树。 为了学习这些树，Python实现使用该库，MATLAB和R / C实现分别是编写的C代码的MATLAB和R包装器，而R / randomForest实现使用R包。 R / C实现是最快的GENIE3实现，是为SCENIC管道开发

大数据-算法-高维线性模型和部分线性模型的相合统计推断.pdf

SpiecEasi 生态联系的稀疏逆协方差估计和统计推断 该软件包对于希望为各种组成数据推断图形模型的人很有用，尽管它主要用于微生物组相对丰度数据（由16S扩增子序列数据生成）。 它还包括一个用于[过度分散，零膨胀]多元相关计数数据的生成器。 请参阅发表的论文。 关于符号的一个小问题：我们将该方法称为“ SPIEC-EASI”，并为此包保留了“ SpiecEasi”。 目录 安装 开发工具 我假设所有辅助软件包都已安装-例如pulsar，large，MASS等。如果遇到意外错误，则可能需要下载并安装缺少的依赖项。 在交互式R会话中： library(devtools) install_github("zdk123/SpiecEasi") library(SpiecEasi) conda SpiecEasi也可以通过conda来源获得，并且应该始终与该存储库的主分支保持最新。 co

因果推断是研究如何更加科学地识别变量间的因果关系及多期DID和事件研究法的数据和代码 　　客观事物普遍存在着内在的因果联系，人们只有弄清事物发展变化的前因后果，才能全面地、本质地认识事物。基干事物发展的这种规律，在论证观点时，有时就可以直接从事物本身的因果关系中进行推论，这就叫因果推断法。 　　世上万事万物，有因就有果，有果必有因。说明事物为什么会发生、为什么会得到某种结果，都是通过论述事物的运动发展的因果关系来完成的。 　　因果推论要求原因先于结果，原因与结果同时变化或者相关，对于结果不存在其他可能的解释，强调原因的唯一性。 部分文献如下：McGavock T. Here waits the bride? The effect of Ethiopia's child marriage law[J]. Journal of Development Economics, 2021, 149: 102580.

贝叶斯统计是在经典统计的争论中逐渐发展起来的。争论的问题有：位置参数是否可以看作随机变量？事件的概率是否一定要有频率解释？概率是否可用经验来确定？在这些问题的争论中，贝叶斯学派建立起自己的理论和方法。

盐源盆地重力异常解释推断及成盐远景区预测.pdf