matlab灰色处理代码颗粒/细胞追踪(Matlab)
概述
此存储库包含使用Matlab跟踪粒子运动的源代码。
该程序可以处理荧光或暗场电影(即,对象应比背景亮)以及相衬电影(即对象应比背景暗)跟踪。
该功能可与Matlab
2018a一起使用,并且也应与以前的Matlab版本(2014a之前的版本)兼容。
在早期的Matlab中,使用Windows
OS将图像保存到'.tif'堆栈时,函数imwrite可能会导致问题。
'.tif'堆栈和'.nd2'NIS-Elements文件均受支持。
如果您的电影(或图像)采用其他格式,例如'.avi'或'.jpg'
,则可以使用ImageJ将电影转换为'.tif'堆栈。
影片应为灰度(uint16或unit8)。
对于“
.nd2”文件,电影文件应为一个系列。
现在,该脚本用于将“
.nd2”文件加载到Matlab中。
它还在提供了Linux版本。
如果您熟悉,可以将此仓库更改为“
ND2withBioFormat”通道以进行跟踪。
引用为
左文龙。
吴仪琳(2020)。
动态动力选择驱动细菌群中的种群隔离。
程序。
Natl。
学院科学20
2021-10-13 09:37:11
6.09MB
系统开源
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