NIFTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative,神经影像信息技术倡议)格式图像(.nii文件)。数据解析参照这里https://qianlingjun.blog.csdn.net/article/details/115726615
2021-12-09 20:06:02 103.12MB python nii NIFTI
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1.NIFTI格式图像图像来源 很有必要自己浏览这个网址,详细介绍了NIFTI的细节 有助于代码理解的点做以下总结: nifti格式存储的数据使用了一对文件**.hdr/.img** nifti格式中,前三个维度以定义三个空间维度-x,-y和-z,第四个维度定义时间点-t。其余维度(五到七)用于其他用途。比如,第五维可以存一些预定义的用途,例如存储体素特定的分布参数或保存基于矢量的数据。 2.NiBabel包 NiBabel包是可以对常见的医学和神经影像文件格式进行读写 import matplotlib from matplotlib import pylab as plt import n
2021-11-29 21:31:36 246KB IF ni python
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主要介绍了Ubuntu+python将nii图像保存成png格式,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧
2021-11-13 10:29:14 37KB python nii保存成png
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利用python 将dicom转换为nii格式并进行保存。
2021-10-29 10:01:28 540B python dicom nii
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主要介绍了python使用nibabel和sitk读取保存nii.gz文件实例,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
2021-10-28 16:57:43 53KB python nibabel sitk nii.gz
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Lambar_Spine_Slicer 腰椎影像智能分割可视化系统,采用Vue+Django框架,3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件,并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。 框架 在pycharm中运行Djsngo文件即可 前端代码在Vue中修改,默认8888端口 下载 下载相关依赖库 numpy SimpleITK nibabel scipy pytorch 训练 训练时将训练集和测试集的数据和标签文件名称存在txt文件中,dataset类中获取数据 ,在utils类中处理数据 处理操作: ct影像阈值截断 归一化 缩小分辨率 使用dice值评估分割的准确率 config文件中设置相关参数 设置训练的模型大小,每次在输入文件中截取该大小的部分进行训练。 可以加上attention机制提高准确率 三维建模 将nii转为stl模型文件展示椎间盘,神经根,类囊膜渲染在前端 引用
2021-10-22 19:14:12 14.42MB JavaScript
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基于matlab的dicom、nii文件读取,去噪增强处理,里面包含了三张dicom的图像,三张nii的图像,需要的同学自己取,稍微收点积分意思意思
2021-10-19 15:16:43 1.76MB matlab dicom nii
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ADNI数据集:.nii格式转换为.png格式 1、共有AD_001-AD_015共15个.nii文件 分别查看每个文件的详细信息,以得到shape维度信息 import nibabel as nib file = 'D:\\图像分割\\AD\\AD_015\\AD_015.nii' #你的nii或者nii.gz文件路径 img = nib.load(file) print(img) 2、通过查看得到每个文件都为四维,只是大小不同 开始进行格式转换 import os import numpy as np import nibabel as nib import imageio im
2021-10-04 10:13:28 67KB ng ni png
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因为后期主要的研究方向是医学图像处理,而现有手头的大部分数据都是nii格式或者是hdr,img格式的数据,所以首先第一步我们需要解决图像的读写问题。 其实使用OpenCV也可以方便的进行图像读取,但是这里暂时只学习Nibabel这个库,后面有时间的话再研究OpenCV在python中的使用。 Nibabel的安装 可以通过pip进行安装 pip install nibabel 简单的图像读取和存储操作 import os import nibabel as nib # 读取图像\npath='C:\\Users\\Darren\\Desktop\\example.nii.gz' img=nib.
2021-09-27 19:36:03 46KB ab babel ni
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MATLAB Nifti程序包用于写入、读取和处理医学影像
2021-09-06 13:14:15 36.78MB MATLAB Nifti dicom nii
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