1. 批量生成每张图片的标注结果文件夹(含 img.png, label.png, label_names.txt,
label_viz.png）
2. 将所有.json 导出的标注文件夹中的 img.png, label.png 复制到相应的 img 和
label 文件夹中
3. 将 labelme 产生的 label 转化为二值图（ 红色替换为白色）
4. 将二值图转 nii
2022-09-11 18:34:26
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用于Python和Matlab的NifTI图像转换器（nii2png）
使OpenCV用户欢欣鼓舞，它是一种实际上有效的轻量级神经成像.nii至.png转换器。
现在支持Python3和Matlab 2017b！
环境
Python 3.7（或Matlab 2017b）
Matlab用法
将脚本添加到路径。 只需输入以下内容并按回车即可运行它：
nii2png
选择您的工作目录。
选择您的NIfTI映像。
如果需要，请旋转图像：
>> Would you like to rotate the orientation? (y/n)
>> y
>> OK. By 90° 180° or
2022-08-26 15:41:53
7KB
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使用VTK和Qt5的NIfTI（nii.gz）3D可视化工具
使用Python运行
创建一个虚拟环境。 Mac可以使用virtualenv或conda。 Windows必须使用conda。
安装依赖项（PyQt5，vtk和sip） pip install PyQt5 vtk
启动程序python ./visualizer/brain_tumor_3d.py -i "./sample_data/10labels_example/T1CE.nii.gz" -m "./sample_data/10labels_example/mask.nii.gz"
生成PyInstaller二进制文件
注意：必须修改.spec文件中的路径以匹配您的项目目录
Mac： pyinstaller Theia_Mac.spec
Windows： pyinstaller Theia_Windows.spec
测试
2022-04-02 10:42:50
119.03MB
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Rejoice 医学影像/计算机视觉研究人员，这是一款轻量级的神经影像 .nii 到 .png 转换器，可满足您的图像处理需求。
1. 将您的脚本添加到您的路径中。 只需输入以下内容并按回车键即可运行它：nii2png 2. 选择您的工作目录。 3. 选择您的 NIfTI 图像。 4. 如果您愿意，可以旋转您的图像。 5. 让它运行。 6. 您的 png 文件现在位于您工作目录的 png 文件夹中。
2022-03-23 18:27:47
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主要介绍了Pytorch 使用 nii数据做输入数据的操作，具有很好的参考价值，希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
2022-03-13 22:14:17
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之前介绍过单个nii文件转换成png图像：
https://www.jb51.net/article/165693.htm
这里介绍将多个nii文件（保存在一个文件夹下）转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。
import numpy as np
import os #遍历文件夹
import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包
import imageio #转换成图像
def nii_to_image(niifile):
filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹
slice_trans
2021-12-27 09:12:06
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使用pix2pix-gan做医学图像合成的时候，如果把nii数据转成png格式会损失很多信息，以为png格式图像的灰度值有256阶，因此直接使用nii的医学图像做输入会更好一点。
但是Pythorch中的Dataloader是不能直接读取nii图像的，因此加一个CreateNiiDataset的类。
先来了解一下pytorch中读取数据的主要途径——Dataset类。在自己构建数据层时都要基于这个类，类似于C++中的虚基类。
自己构建的数据层包含三个部分
class Dataset(object):
"""An abstract class representing a Dataset.
A
2021-12-14 21:17:21
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