2010年A题《确定肿瘤基因信息》指导老师评论文章。

matlab图像分割肿瘤代码脂蛋白 sephaCe是基于Matlab / C的应用程序，仅使用明场显微镜图像数据即可自动分割生物细胞边界和细胞核。 官方的Github仓库位于。 描述sephaCe的文献为： “从明场显微镜图像中自动分离粘附的生物细胞边界和细胞核”，机器视觉与应用，2011（）（） “关于将低通滤波器用于逆拉普拉斯模型的图像处理”，《数学光子与影像学报》，2011年（） 主应用程序位于“主”文件夹中。 首先，在Matlab中加载“ segment_tool.m”脚本。 完整说明位于“ README.TXT”文件中。 请注意，主应用程序对第​​三方和已编译的C代码有一些依赖关系。 它是在32位Windows XP笔记本电脑上开发和测试的。 如果需要在其他平台上运行它，则需要重新编译“ To Compile”文件夹中的二进制文件，并在“ 3rd Party Libs”文件夹中获取第三方库的二进制文件。 更快的选择是使用最小代码版本，这是不包含GUI的简单脚本。 这些位于“最小代码”文件夹中。 有两种版本，一种版本仅执行自动单元格检测（在“仅Init”中；运行“ sephac

大量RNA序列淋巴球 淋巴管内皮细胞的RNA seq数据分析（用肿瘤分泌物组或VEGF-C处理） 命令行的详细列表，用于分析从原始计数到差异表达分析（基于edgeR程序包）和基因集富集分析（使用fgsea和clusterProfiler）的大量RNA测序数据。 还包括用于显示多个关联的热图的代码（heatmap.2和pheatmap程序包）

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