matlab
copula代码乌克萨
不确定性量化
(UQ)
和灵敏度分析
(SA)
此存储库中分发的代码实现了
Eriksson
和
Jauhiainen
等人(2018
年)在论文“贝叶斯分析结合全局敏感性分析应用于动态细胞内通路模型的不确定性量化、传播和表征”中提出的方法。
该代码在
GNU
通用公共许可证
v3.0
下分发。
UQ
文件夹包含运行不确定性量化方法的
R
脚本(ABC-MCMC
with
copulas)。
需要包
ks、VineCopula、MASS、R.utils
和
R.matlab(将输出数据保存到
MATLAB
兼容文件的最后一个包)。
要运行的主脚本称为
runABCMCMC-Phenotype123.R。
该脚本将使模型适合表型
1-3(如论文中所述),我们将其用作说明性测试用例。
结果数据也以
R
和
MATLAB
格式上传到文件夹中。
我们使用表型
4
作为我们的预测数据集来说明
SA
方法。
SA
文件夹包含运行全局敏感性分析的
MATLAB
脚本。
需要
2014a
之后的
MATLAB
版本。
要运行的主脚本称为
get_predictio
2021-12-07 18:43:39
981KB
系统开源
1