知识领域解释
该软件使用 Kauffman 的 NK 自动机模拟生命细胞遗传调控。 N 代表细胞具有的基因数量。 K 代表每个基因行为所依赖的基因数量。 在这个模型中,基因大致是一个布尔变量,可以是真或假(基因可以处于状态:主动或被动)。 所有基因在特定离散时刻的状态都是细胞状态。 该模型描述了活细胞调节机制,即基因的相互作用如何定义细胞状态的序列。
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一个活细胞中有许多细胞器。 但我们对细胞核(部分与线粒体)感兴趣
细胞核中漂浮着染色体
染色体由基因组成。 它们调节细胞。
但他们并不是孤立的。 它们在大规模范围内相互作用。
有时有一些孤立的基因亚群,它们只与亚群中的基因相互作用。
基因是基因组的一个功能单位。 它可以做某事并被激活 (1) 或什么都不做并被停用 (0)。 它可以挖也可以不挖,但不能两者都挖
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