funannotate是用于基因组注释的管道（专门为真菌构建，但也可用于高级真核生物）。 有关安装，使用和更多信息，请参见 最快启动Docker： 您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是，GeneMark不包含在Docker映像中（请参阅下面的许可，您可以向开发人员投诉，因为它难以分发/使用）。 我还编写了一个bash脚本，该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的，因此它将早于标记的发行版。 该映像还包括所需的数据库，如果您只想在没有数据库的情况下进行注解，则该映像位于nextgenusfs/funannotate-slim hub以及nextgenusfs/funannotate-slim 。 因此，可以通过以下方式实现此路线： # download/pull th

摘要：随着测序技术进步和测序成本下降，越来越多的基因组项目得以启动并相继完成，生物领域科研人员对基因组注释信息自动化管理及可视化展示的需求越来越迫切。本文针对基因组注释信息维护和使用的需要，设计并开发了基因组注释管理系统。该系统采用当前流行的MVC设计模式，使用Django技术，利用Python、JavaScript、Html5以及CSS3语言进行开发。它可以利用用户上传的基因组序列和gff3注释文件自动化生成CDS序列、蛋白质序列以及功能注释信息等，并支持Blast序列相似性搜索、基因ID和注释功能关键词搜索。经过测试，该系统性能稳定，能满足用户的基本需求。 关键词：基因组注释；基因结构维护；可视化展示；功能注释

随着测序技术进步和测序成本下降，越来越多的基因组项目得以启动并相继完成，生物领域科研人员对基因组注释信息自动化管理及可视化展示的需求越来越迫切。本文针对基因组注释信息维护和使用的需要，设计并开发了基因组注释管理系统。该系统采用当前流行的MVC设计模式，使用Django技术，利用Python、JavaScript、Html5以及CSS3语言进行开发。它可以利用用户上传的基因组序列和gff3注释文件自动化生成CDS序列、蛋白质序列以及功能注释信息等，并支持Blast序列相似性搜索、基因ID和注释功能关键词搜索。经过测试，该系统性能稳定，能满足用户的基本需求。

文章目录MEGAN-宏基因组功能和物种分类MEGAN功能简介原理简要示意图MEGAN特有文件格式：RMAMEGAN下载MEGAN使用MEGAN（linux版本安装）MEGAN使用指南（Linux）提取注释内容（物种和功能）：提取物种注释数据：提取功能：Win版安装和使用MEGAN安装Win版使用指南MEGAN主界面介绍MEGAN输入介绍MEGAN分析进阶双样本比对MEGAN界面可视化-两样本（.rma）比对物种信息可视化功能信息可视化数据导出MEGAN多个样本分析方案猜你喜欢写在后面 有时间可以写一个megan的中文教程。详细介绍软件、数据库安装，示例数据分析和结果描述。这个也引用了几千次，可