路径映射器 PathwayMapper是一个基于网络的途径管理工具,用于交互式创建,编辑和共享癌症途径。 该工具支持远程用户使用进行协作并同时修改路径, 具有作为组件实现的内置冲突解决方案。 构建了特殊的ViewwayMapper查看器版本,以在cBioPortal中使用( ,)。 以下是有关PathwayMapper基础的视频教程: 如何引用用法 Bahceci等。 (2017)“ ”,生物信息学。 反馈 请将任何反馈和错误报告发送至 。 软件 PathwayMapper是根据。 可以在此处找到示例部署。 运行本地实例 为了部署和运行该工具的本地实例,请按照以下步骤操作: 首先,将PathwayMapper克隆到本地计算机,然后导航到本地存储库: 安装 git clone https://github.com/iVis-at-Bilkent/pathway-mapper.gi
2025-12-26 14:38:09 5.28MB bioinformatics tcga pathways
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陆地棉茎尖iTRAQ蛋白质组学分析表明植物激素相关信号传导与矮化相关,屠小菊,汪启明,基于陆地棉矮化株系LA-1及高杆的近等基因系LH-1在植株高度存在明显差异,本文对LA-1及近等基因系LH-1茎尖进行了iTRAQ定量蛋白质组学分析
2025-07-09 20:56:28 1.15MB 首发论文
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乙型肝炎病毒X蛋白与ECSIT蛋白相互作用促进白介素1诱导的NF-kB信号通路的激活,陈婉南,刘玲玲,乙型肝炎病毒X蛋白(HBx蛋白)可反式激活多种转录因子,其中包括可以调节多种炎症相关基因的核因子κB(NF-κB)。然而HBx蛋白在NF-κB�
2024-02-25 23:04:32 840KB 首发论文
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Hsp90参与调节蜕皮激素20E和保幼激素信号通路,刘文,赵小凡,由于热休克蛋白90(Hsp90)常与甾醇类激素受体,信号转导相关激酶,以及参与多种肿瘤调节的转录因子相互作用,所以它是热休克蛋白�
2024-02-25 23:01:17 1.02MB 首发论文
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MEK/ERK和PI3K/Akt信号通路参与调节肿瘤细胞对TRAIL敏感性的研究,方方,洪素丽, 
2024-02-25 22:59:37 584KB 首发论文
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17β-雌二醇通过PI3K/AKT和雌激素受体信号通路上调NRF2抑制光损伤诱导的SD大鼠视网膜神经变性,朱春晖,李红波,人类年龄相关性视网膜疾病,如年龄相关性黄斑变性(AMD),与组织的氧合水平降低及缺氧密切相关。当前,不同的抗氧化剂被用以缓解
2024-01-09 15:46:24 1.27MB 首发论文
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生化途径海报 在正式停止其著名的生化途径海报的印刷生产后,罗氏通过一个提供了这些海报。 不幸的是,这使想要纸质副本的人没有一个好的选择。 该脚本将从服务器上托管的图块下载并组装“代谢途径”海报,从而为您提供大的可打印PNG文件。 要求 您将需要满足以下要求: Python > 3.5.2 。 该脚本将在OSX和Linux计算机上运行。 Windows尚未经过测试。 安装在要求requirements.txt运行 pip install -r requirements.txt 用法 使用以下命令从命令行运行脚本 python extract_metabol.py 如果同时安装了python2和python3,请确保使用python3调用脚本。 python3 extract_metabol.py 这会将所有原始图块转储到images/ ,将组装后的层转储到assembled/
2023-04-09 18:53:37 33.63MB Python
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