gromacs2020.4 windows编译版（支持GPU加速）无脑安装，一直点下一步即可。 只要是独立显卡的电脑都可以支持GPU加速（本人尝试过低端显卡MX130以及高端显卡RTX2060均可成功）

安装教程可在本人个人主页中（往期博文）找到

用于gromacs做QM_MM的一些文件和教程，仅用于个人学习！

%% TPR2PDB.m % % Gromacs 对于模拟全原子系统很有用，它启动了这些% 使用 TPR 文件进行模拟。 所有 TPR 文件都包含坐标数据% 启动模拟。 有时打开并检查它是有用的％ 结构体。 该程序提取它并将其转换为 PDB 格式以供% 方便查看。 提取的信息是坐标、原子类型、 % 和部分费用。 部分费用存储在 beta-factor 列中% 的输出文件。 % % ％ - - - 要求 - - - % % GROMACS % 这个程序使用 Gromacs 命令“GMXdump”来创建一个文本％ 文件。 这避免了 Gromacs 可能出现的任何问题% 更新和版本更改。 确保此命令有效％ 小路。 % % gmxdump ％ 看上面。 启动这个文件的命令是% $> gmxdump -s [TPR 文件] > textForAnalysis.txt % 如果这不能正确完成，

md-scripts:有助于在Gromacs上准备和运行MD模拟的Python和Bash脚本

gromacs-5.0.7分子动力学软件，linux版

由top文件、mdp文件、gro文件所生成，用于gromacs软件性能测试时所使用。体系为水分子体系，步长为100000.

欢迎使用gmx_MMPBSA！ gmx_MMPBSA是一种新工具，可根据AMBER的MMPBSA.py和GROMACS文件执行最终状态自由能计算。 请在查看文档

Gromacs教程-水中的溶菌酶,讲述如何使用GROMACS模拟蛋白质与水的作用。

lammps分子动力学、gromacs分子动力学、与第一性原理vasp